草莓轻型黄边病毒中国分离物全基因组序列测定和分析 |
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引用本文: | 江山,陈道,叶立乐,张洁,吴祖建,丁新伦.草莓轻型黄边病毒中国分离物全基因组序列测定和分析[J].病毒学报,2022(5):1187-1194. |
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作者姓名: | 江山 陈道 叶立乐 张洁 吴祖建 丁新伦 |
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作者单位: | 福建农林大学植物病毒研究所福建省植物病毒重点实验室闽台作物有害生物生态防控国家重点实验室 |
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基金项目: | 福建农林大学横向科技项目(项目号:KH210077A),题目:草莓病毒病害检测与防控~~; |
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摘 要: | 草莓轻型黄边病毒(Strawberry mild yellow edge virus,SMYEV)是引起我国草莓病毒病害的重要病毒之一,我们测定了共侵染草莓植株的2个SMYEV中国分离物FJ1和FJ2的全基因组序列。FJ1和FJ2分离物基因组全长均为5 971 nt,包含5个开放阅读框(ORF),其中,FJ2分离物ORF4编码蛋白C端缺乏7 aa。SMYEV分离物FJ1和FJ2的基因组核苷酸序列一致性为89.8%,两者和其他SMYEV分离物的基因组核苷酸序列一致性分别为83.7%~89.8%和84.1%~90.0%;基于CP基因的系统进化分析表明,SMYEV分离物分为2个大组群4个亚群,FJ1和FJ2分别归属不同的组,两者具有较远的亲缘关系,其中FJ1与中国分离物sy01和sy04、日本分离物T1以及韩国分离物KNS1亲缘关系最近,FJ2与中国分离物sy02、加拿大一株分离物PEI113_12以及日本分离物T2亲缘关系最近。RDP4重组分析表明,FJ1和FJ2均存在潜在的重组事件。本研究首次报道了我国SMYEV基因组全长序列,为该病毒在我国的侵染流行、检测和防控提供了理论基础。
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关 键 词: | 草莓 草莓轻型黄边病毒 基因组全长 序列分析 |
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