草莓轻型黄边病毒中国分离物全基因组序列测定和分析

草莓轻型黄边病毒（Strawberry mild yellow edge virus,SMYEV）是引起我国草莓病毒病害的重要病毒之一，我们测定了共侵染草莓植株的2个SMYEV中国分离物FJ1和FJ2的全基因组序列。FJ1和FJ2分离物基因组全长均为5 971 nt，包含5个开放阅读框（ORF），其中，FJ2分离物ORF4编码蛋白C端缺乏7 aa。SMYEV分离物FJ1和FJ2的基因组核苷酸序列一致性为89.8%，两者和其他SMYEV分离物的基因组核苷酸序列一致性分别为83.7%～89.8%和84.1%～90.0%；基于CP基因的系统进化分析表明，SMYEV分离物分为2个大组群4个亚群，FJ1和FJ2分别归属不同的组，两者具有较远的亲缘关系，其中FJ1与中国分离物sy01和sy04、日本分离物T1以及韩国分离物KNS1亲缘关系最近，FJ2与中国分离物sy02、加拿大一株分离物PEI113＿12以及日本分离物T2亲缘关系最近。RDP4重组分析表明，FJ1和FJ2均存在潜在的重组事件。本研究首次报道了我国SMYEV基因组全长序列，为该病毒在我国的侵染流行、检测和防控提供了理论基础。