四川省鸭坦布苏病毒的分离鉴定及遗传进化分析

本研究从四川省什邡市某发病养鸭场采集到疑似鸭坦布苏病毒（Duck Tembusu virus,DTMUV）感染的病料，将病料组织研磨，无菌处理后接种鸭胚连续传代培养，分离获得一株病毒，并通过PCR鉴定以及电镜形态观察，确定该分离株为黄病毒属坦布苏病毒，命名为SCS01。将SCS01株全基因组进行PCR分段扩增测序发现，SCS01株全基因组全长为10 992bp。在线BLAST比对检索，结果显示，SCS01株全基因组与国内鸭源坦布苏分离株同源性最高可达97.94%，进化树分析显示，SCS01株属于中国流行I群毒株，与多数分离自北方地区的中国II群毒株相比，具有较为明显的地方特性。分离株与所有参考毒株的E基因核苷酸和氨基酸相似性均在90%以上，其中与重庆分离株CQW1的相似性最高。这一鸭源坦布苏病毒的分离及其全基因组的测定为进一步探究坦布苏病毒的地区流行提供了材料。