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滇金丝猴粪便微生物GH10家族木聚糖酶基因多样性
引用本文:戴利铭,邓梦,黄遵锡,王余娇,李俊俊,周峻沛,慕跃林,许波. 滇金丝猴粪便微生物GH10家族木聚糖酶基因多样性[J]. 微生物学通报, 2016, 43(1): 44-50
作者姓名:戴利铭  邓梦  黄遵锡  王余娇  李俊俊  周峻沛  慕跃林  许波
作者单位:1. 云南师范大学生命科学学院 云南 昆明 650500,1. 云南师范大学生命科学学院 云南 昆明 650500,1. 云南师范大学生命科学学院 云南 昆明 650500;2. 生物能源持续开发利用教育部工程研究中心 云南 昆明 650500;3. 云南省生物质能与环境生物技术重点实验室 云南 昆明 650500;4. 云南师范大学酶工程重点实验室 云南 昆明 650500,1. 云南师范大学生命科学学院 云南 昆明 650500,1. 云南师范大学生命科学学院 云南 昆明 650500;2. 生物能源持续开发利用教育部工程研究中心 云南 昆明 650500;3. 云南省生物质能与环境生物技术重点实验室 云南 昆明 650500;4. 云南师范大学酶工程重点实验室 云南 昆明 650500,1. 云南师范大学生命科学学院 云南 昆明 650500;2. 生物能源持续开发利用教育部工程研究中心 云南 昆明 650500;3. 云南省生物质能与环境生物技术重点实验室 云南 昆明 650500;4. 云南师范大学酶工程重点实验室 云南 昆明 650500,1. 云南师范大学生命科学学院 云南 昆明 650500;2. 生物能源持续开发利用教育部工程研究中心 云南 昆明 650500;3. 云南省生物质能与环境生物技术重点实验室 云南 昆明 650500;4. 云南师范大学酶工程重点实验室 云南 昆明 650500,1. 云南师范大学生命科学学院 云南 昆明 650500;2. 生物能源持续开发利用教育部工程研究中心 云南 昆明 650500;3. 云南省生物质能与环境生物技术重点实验室 云南 昆明 650500;4. 云南师范大学酶工程重点实验室 云南 昆明 650500
基金项目:国家自然科学基金项目(No. 31160229,31360268)
摘    要:【目的】分析滇金丝猴粪便微生物中GH10家族木聚糖酶的基因多样性。【方法】以野生和半圈养滇金丝猴粪便微生物宏基因组DNA为模板,用GH10木聚糖酶简并引物扩增木聚糖酶基因片段,利用p MD19-T载体构建细菌克隆文库并进行分析。【结果】从野生和半圈养滇金丝猴粪便微生物克隆文库中分别获得26、28条GH10木聚糖酶基因片段,与Gen Bank中木聚糖酶序列一致性分别介于58%-95%、63%-81%之间。比对分析表明,两种环境中的GH10木聚糖酶均来自厚壁菌门、拟杆菌门和未培养细菌。野生滇金丝猴粪便微生物的GH10木聚糖酶基因来源于Uncultured bacterium和Butyrivibrio、Bacteroides、Ruminococcus、Sphingobacterium、Chryseobacterium、Clostridium、Bacillus 7个属;而半圈养滇金丝猴粪便微生物的GH10木聚糖酶基因来源于Uncultured bacterium和Clostridium、Paludibacter、Sphingobacterium、Ruminococcus、Roseburia、Chryseobacterium 6个属,其中两种环境都存在来源于Ruminococcus、Clostridium、Chryseobacterium、Sphingobacterium的GH10木聚糖酶。【结论】滇金丝猴粪便微生物中含有丰富的GH10木聚糖酶基因,且野生和半圈养两种不同环境中GH10木聚糖酶基因的微生物来源存在一定差异。该研究丰富了动物胃肠道中GH10木聚糖酶基因多样性,并为新型木聚糖酶的开发和滇金丝猴胃肠道微生物资源的利用奠定了基础。


Gene diversity of the glycosyl hydrolase family 10 xylanase in the fecal microorganism of Rhinopithecus bieti
DAI Li-Ming,DENG Meng,HUANG Zun-Xi,WANG Yu-Jiao,LI Jun-Jun,ZHOU Jun-Pei,MU Yue-Lin and XU Bo. Gene diversity of the glycosyl hydrolase family 10 xylanase in the fecal microorganism of Rhinopithecus bieti[J]. Microbiology China, 2016, 43(1): 44-50
Authors:DAI Li-Ming  DENG Meng  HUANG Zun-Xi  WANG Yu-Jiao  LI Jun-Jun  ZHOU Jun-Pei  MU Yue-Lin  XU Bo
Affiliation:1. School of Life Sciences, Yunnan Normal University, Kunming, Yunnan 650500, China,1. School of Life Sciences, Yunnan Normal University, Kunming, Yunnan 650500, China,1. School of Life Sciences, Yunnan Normal University, Kunming, Yunnan 650500, China;2. Engineering Research Center of Sustainable Development and Utilization of Biomass Energy, Ministry of Education,Kunming, Yunnan 650500, China;3. Key Laboratory of Yunnan for Biomass Energy and Biotechnology of Environment, Kunming, Yunnan 650500, China;4. Key Laboratory of Enzyme Engineering, Yunnan Normal University, Kunming, Yunnan 650500, China,1. School of Life Sciences, Yunnan Normal University, Kunming, Yunnan 650500, China,1. School of Life Sciences, Yunnan Normal University, Kunming, Yunnan 650500, China;2. Engineering Research Center of Sustainable Development and Utilization of Biomass Energy, Ministry of Education,Kunming, Yunnan 650500, China;3. Key Laboratory of Yunnan for Biomass Energy and Biotechnology of Environment, Kunming, Yunnan 650500, China;4. Key Laboratory of Enzyme Engineering, Yunnan Normal University, Kunming, Yunnan 650500, China,1. School of Life Sciences, Yunnan Normal University, Kunming, Yunnan 650500, China;2. Engineering Research Center of Sustainable Development and Utilization of Biomass Energy, Ministry of Education,Kunming, Yunnan 650500, China;3. Key Laboratory of Yunnan for Biomass Energy and Biotechnology of Environment, Kunming, Yunnan 650500, China;4. Key Laboratory of Enzyme Engineering, Yunnan Normal University, Kunming, Yunnan 650500, China,1. School of Life Sciences, Yunnan Normal University, Kunming, Yunnan 650500, China;2. Engineering Research Center of Sustainable Development and Utilization of Biomass Energy, Ministry of Education,Kunming, Yunnan 650500, China;3. Key Laboratory of Yunnan for Biomass Energy and Biotechnology of Environment, Kunming, Yunnan 650500, China;4. Key Laboratory of Enzyme Engineering, Yunnan Normal University, Kunming, Yunnan 650500, China and 1. School of Life Sciences, Yunnan Normal University, Kunming, Yunnan 650500, China;2. Engineering Research Center of Sustainable Development and Utilization of Biomass Energy, Ministry of Education,Kunming, Yunnan 650500, China;3. Key Laboratory of Yunnan for Biomass Energy and Biotechnology of Environment, Kunming, Yunnan 650500, China;4. Key Laboratory of Enzyme Engineering, Yunnan Normal University, Kunming, Yunnan 650500, China
Abstract:
Keywords:Culture-independent   Rhinopithecus bieti   Fecal microorganism   Xylanase   Diversity
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