| 基于处方挖掘与分子动力学模拟筛选严重急性呼吸综合征冠状病毒2潜在抑制剂分子的研究 |
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| 引用本文： | 张晓铮,高颖,刘玉,邰杨浩,梁力中,张玉龙,侯淑琳,解军.基于处方挖掘与分子动力学模拟筛选严重急性呼吸综合征冠状病毒2潜在抑制剂分子的研究[J].生物化学与生物物理进展,2022,49(10):1889-1900. |
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| 作者姓名： | 张晓铮 高颖 刘玉 邰杨浩 梁力中 张玉龙 侯淑琳 解军 |
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| 作者单位： | 1）山西医科大学基础医学院,生物化学与分子生物学教研室,出生缺陷与细胞再生山西省重点实验室,太原 030001,1）山西医科大学基础医学院,生物化学与分子生物学教研室,出生缺陷与细胞再生山西省重点实验室,太原 030001,1）山西医科大学基础医学院,生物化学与分子生物学教研室,出生缺陷与细胞再生山西省重点实验室,太原 030001,2）山西医科大学第二临床医学院,太原 030001,3）山西医科大学第一临床医学院,太原 030001,4）中国科学院广州生物医药与健康研究院,呼吸疾病国家重点实验室,广州 510530,1）山西医科大学基础医学院,生物化学与分子生物学教研室,出生缺陷与细胞再生山西省重点实验室,太原 030001,1）山西医科大学基础医学院,生物化学与分子生物学教研室,出生缺陷与细胞再生山西省重点实验室,太原 030001 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金（22007062）,山西省高等学校大学生创新创 业训练项目（S2021101140230）, 山西省基础研究计划 （202103021224236） 和山西医科大学博士科研启动基金（XD1911） 资助项目。 |
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| 摘 要： | 目的 从中药筛选具有潜在抑制严重急性呼吸综合征冠状病毒2 （SARS-CoV-2） 活性的成分,进一步从原子水平揭
示其抑制SARS-CoV-2 表面刺突蛋白（S 蛋白） 受体结合域（RBD） 与血管紧张素转化酶2 （ACE2） 结合的内在机制。
方法 检索新型冠状病毒（简称“新冠肺炎”） 治疗中药处方,构建“新冠肺炎中药候选活性成分数据库”。用具有ACE2
抑制活性的小分子化合物构建HipHop药效团模型,并对“新冠肺炎中药候选活性成分数据库”中活性成分筛选。采用分子
对接和分子动力学模拟方法研究候选活性成分与ACE2 的结合方式及其对SARS-CoV-2 S 蛋白与ACE2 识别的影响。
结果 本文通过中药处方挖掘和分子动力学模拟,从143 个新冠肺炎治疗中药处方中筛选出10 种可与SARS-CoV-2 S 蛋白/
人源ACE2 识别位点结合的中药成分。其中,枇杷叶主要活性成分23-trans-p-coumaryhormentic acid 与ACE2 具有最高的亲和
力,且23-trans-p-coumaryhormentic acid 的结合可有效阻断SARS-CoV-2 S蛋白与宿主细胞ACE2 的结合。结论 本文通过虚
拟筛选发现了SARS-CoV-2 潜在抑制剂分子23-trans-p-coumaryhormentic acid,同时从原子水平预测了其抑制SARS-CoV-2 S
蛋白与ACE2 结合的内在机制,这将为SARS-CoV-2 特异性抗病毒药物的研发提供理论依据。
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| 关 键 词： | 严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2抑制剂 中药处方 数据挖掘 分子对接 分子动力学模拟 |
| 收稿时间： | 2022/5/17 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2022/9/13 0:00:00 |
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