| 利用蛋白质相互作用关系改善基因芯片缺失数据估计的精度 |
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| 引用本文： | 倪青山,王广云,邱浪波,强波,王正志. 利用蛋白质相互作用关系改善基因芯片缺失数据估计的精度[J]. 生命科学研究, 2008, 12(2) |
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| 作者姓名： | 倪青山 王广云 邱浪波 强波 王正志 |
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| 作者单位： | 1. 国防科技大学机电工程与自动化学院,中国湖南长沙,410073
2. 空军工程大学电讯工程学院,中国陕西西安,710077 |
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| 摘 要： | 针对基因芯片数据缺失问题,利用蛋白质相互作用关系与基因表达的内在联系,提出了一种利用蛋白质相互作用信息提高基因芯片缺失数据估计精度的方法.将蛋白质间的相互作用关系与基因表达数据间的距离相结合来计算基因间的表达相似度,根据这个新的相似性度量标准为含有缺失数据的基因选择更为合适的用于估计缺失值的基因集合.将新的相似性度量标准与传统的KNNimpute、 LLSimpute方法相结合,描述了对应的改进算法PPI-KNNimpute、 PPI-LLSimpute.对真实的数据集测试表明,蛋白质相互作用信息能有效改善基因缺失数据估计的精度.
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| 关 键 词： | 基因芯片 缺失值估计 蛋白质相互作用 利用 蛋白质 相互作用关系 改善 基因芯片 缺失数据 估计精度 Protein Interactions Data DNA Microarray Value 信息能 数据集测试 改进算法 对应 描述 缺失值 基因选择 度量标准 相似性 |
Improving Missing Value of DNA Microarray Data by Using Protein- Protein Interactions |
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| NI Qing-shan,WANG Guang-yun,QIU Lang-bo,QIANG Bo,WANG Zheng-zhi. Improving Missing Value of DNA Microarray Data by Using Protein- Protein Interactions[J]. Life Science Research, 2008, 12(2) |
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| Authors: | NI Qing-shan WANG Guang-yun QIU Lang-bo QIANG Bo WANG Zheng-zhi |
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