一个引起玉米矮花叶病的甘蔗花叶病毒基因组全序列测定及其结构分析 |
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引用本文: | 程晔,陈炯,陈剑平.一个引起玉米矮花叶病的甘蔗花叶病毒基因组全序列测定及其结构分析[J].中国科学C辑,2001,31(6):497-504. |
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作者姓名: | 程晔 陈炯 陈剑平 |
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作者单位: | 1. 浙江省农业科学院病毒实验室,杭州,310021 2. 浙江大学生命科学院,杭州,310029 |
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基金项目: | 浙江省青年科技人才专项资金(批准号:RC9604)和浙江省重点实验室专项基金(批准号:001107557)资助项目 |
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摘 要: | 测定了从浙江省呈现矮花叶病症状的玉米上分离得到的一个马铃薯Y病毒属病毒RNA的核苷酸全序列. 该病毒分离物的RNA基因组由9596个核苷酸组成(不包括polyA尾). 单一的ORF由9192个核苷酸组成, 编码一个分子量为346.1 ku的聚合蛋白. 该蛋白结构特征与高粱花叶病毒(SrMV)中国甘蔗分离物和一个玉米矮花叶病毒(MDMV)保加利亚分离物基因组编码的蛋白非常相似. 序列分析表明, 该病毒分离物与甘蔗花叶病毒(SCMV)各分离物(已报道的仅为基因组3′末端序列)同源性最高, 与SrMV和MDMV同源性次之, 而与约翰逊草花叶病毒(JGMV)同源性最低. 根据马铃薯Y病毒属区分不同病毒和株系的分类标准, 报道的玉米病毒分离物应当鉴定为SCMV的一个株系. 然而, 该分离物在HC-Pro, P3和CI蛋白区域和SrMV中国甘蔗分离物具有极高的氨基酸同源性.
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关 键 词: | 甘蔗花叶病毒 基因组结构 分类学 玉米矮花叶病 |
收稿时间: | 2001-06-06 |
修稿时间: | 2001年6月6日 |
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