| 铁皮石斛SPL膜结合(STM)转录因子的全基因组鉴定及表达分析 |
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| 引用本文： | 杨 乐,聂 聪,龙小琴,何基泽,颜超越,朱乾坤,王万军. 铁皮石斛SPL膜结合(STM)转录因子的全基因组鉴定及表达分析[J]. 广西植物, 2023, 43(6): 1041-1050 |
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| 作者姓名： | 杨 乐 聂 聪 龙小琴 何基泽 颜超越 朱乾坤 王万军 |
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| 作者单位： | 西南交通大学 生命科学与工程学院, 成都 610031 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(31900164); 中央高校基本科研业务费(2682021CX121); 西南交大个性化实验项目(GX2021160027)。 |
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| 摘 要： | SPL转录因子广泛参与植物生长发育、胁迫响应等过程。目前,没有关于铁皮石斛SPL膜结合(SPL with transmembrane motif)转录因子即STM转录因子的研究。为了探究STM转录因子在铁皮石斛生长发育及胁迫响应等方面的作用,该文在铁皮石斛全基因组水平鉴定出4个STM转录因子,并对DoSTM基因家族成员进行生物信息学分析,又利用逆转录PCR研究了DoSTM在不同组织部位及不同逆境处理下的表达情况。结果表明:(1)DoSTM1-4为亲水蛋白,均具有SBP保守结构域和一些激素响应位点。(2)4个DoSTM在根茎叶中均有表达,DoSTM2在叶中的相对表达量最低; DoSTM1/3/4的相对表达水平均无明显差异。(3)DoSTM1-4在低温、高温、干旱胁迫下的相对表达水平都有显著变化,DoSTM1/3/4的表达量降低最为明显,故推测DoSTM与植物体内激素响应、温度变化响应及抗旱性有关。这些结论为后续进一步开展铁皮石斛STM转录因子的研究提供了参考。
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| 关 键 词： | 铁皮石斛 STM转录因子 基因鉴定 功能分析 基因表达 |
| 收稿时间： | 2022-01-02 |
Genome-wide identification and expression analysis of SPL with transmembrane motif(STM)transcription factor in Dendrobium officinale |
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| YANG Le,NIE Cong,LONG Xiaoqin,HE Jize,YAN Chaoyue,ZHU Qiankun,WANG Wanjun. Genome-wide identification and expression analysis of SPL with transmembrane motif(STM)transcription factor in Dendrobium officinale[J]. Guihaia, 2023, 43(6): 1041-1050 |
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| Authors: | YANG Le NIE Cong LONG Xiaoqin HE Jize YAN Chaoyue ZHU Qiankun WANG Wanjun |
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| Affiliation: | School of Life Science and Engineering, Southwest Jiaotong University, Chengdu 610031, China |
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