基于mtDNA COⅠ和Cytb基因序列对南中国海不同海域波纹唇鱼群体遗传多样性的研究 |
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引用本文: | 胡静,侯新远,尹绍武,祝斐,贾一何,王小军.基于mtDNA COⅠ和Cytb基因序列对南中国海不同海域波纹唇鱼群体遗传多样性的研究[J].水生生物学报,2014,38(6):1008-1016. |
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作者姓名: | 胡静 侯新远 尹绍武 祝斐 贾一何 王小军 |
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作者单位: | 1. 南京师范大学生命科学学院,南京 210023; 中国水产科学院南海水产研究所热带水产研究中心,三亚 572018 2. 南京师范大学生命科学学院,南京,210023 |
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基金项目: | 国家自然科学基金项目,海南省自然科学基金,“十一五”国家科技支撑计划重点项目,江苏省高校优势学科建设工程项目资助 |
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摘 要: | 研究以海南陵水、马来西亚、西沙、南沙4个海域共101尾波纹唇鱼作为研究对象, 通过线粒体DNA的COⅠ和Cytb基因序列分析方法对波纹唇鱼进行了遗传多样性研究。经PCR扩增、克隆与序列测定, 分别获得1560 bp COⅠ基因和1141 bp Cytb基因序列。两者多态性遗传参数统计显示, 101尾个体分别存在23 (COⅠ)和30 (Cytb)个变异位点, 分别检测出20 (COⅠ)和27 (Cytb)个单倍型, 总群体单倍型多样性(Hd)分别为0.629 (COⅠ)和0.755 (Cytb), 平均核苷酸差异数(K)分别为1.195 (COⅠ)和1.424 (Cytb), 核苷酸多样性指数(Pi)分别为0.00077 (COⅠ)和0.00126 (Cytb)。分子方差分析(AMOVA)结果分别为26.26% (COⅠ)和4.22% (Cytb)的变异来自群体间, 73.74% (COⅠ)和95.78% (Cytb)的变异来自群体内。同时, 两个基因的单倍型网络图呈星状放射结构, 不同地理来源的单倍型无明显分支, 呈交错分布, 没有体现地理差异性。研究初步认为, 波纹唇鱼的遗传多样性处于较低水平, 遗传分化存在但不显著, 该结果可为今后波纹唇鱼的种质资源保护工作提供必要的科学依据。
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关 键 词: | 波纹唇鱼 COⅠ Cytb 遗传多样性 遗传分化 |
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