| 1株人乳头瘤病毒6型山东地方株的全基因组序列分析 |
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| 引用本文： | 张翠,纪峰,林小娟,寇增强,徐爱强,陶泽新,宋艳艳. 1株人乳头瘤病毒6型山东地方株的全基因组序列分析[J]. 病毒学报, 2021, 37(6): 1370-1375. DOI: 10.13242/j.cnki.bingduxuebao.003956 |
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| 作者姓名： | 张翠 纪峰 林小娟 寇增强 徐爱强 陶泽新 宋艳艳 |
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| 作者单位： | 山东大学齐鲁医学院公共卫生学院,济南250012;山东省疾病预防控制中心山东省传染病预防控制重点实验室,济南250014;山东大学齐鲁医学院公共卫生学院,济南250012;山东省疾病预防控制中心山东省传染病预防控制重点实验室,济南250014 |
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| 摘 要： | 人乳头瘤病毒6型(Human papillomavirus type 6,HPV6)是引起生殖器疣与复发性喉乳头瘤的主要病原体之一.为明确2019年济南市1例尖锐湿疣患者的病毒基因组序列特征,本研究提取其尖锐湿疣组织标本总DNA,分两段进行HPV6全基因组PCR扩增和步移法Sanger测序,将拼接后的序列与全球36条不同来源的HPV6全基因组序列进行对比分析.结果 显示,1013/19/JN/CHN/HPV6株(以下简称1013/HPV6)基因组全长8031bp,属于变异谱系B1,与全球不同地区HPV6分离株序列的同源性为98.4％～99.9％.1013/HPV6株与B1亚谱系参考株AF092932全基因组序列相比具有19个核苷酸变异位点,分布在7个开放阅读框架(Open Reading Frames,ORFs)和非编码区内.本研究首次分析了分离自中国大陆的HPV6全基因序列特征,研究结果为HPV分子进化的进一步研究和分型诊断试剂的优化提供了数据.
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| 关 键 词： | 人乳头瘤病毒6型(HPV6) 全基因组 序列分析 系统发生 |
Complete Genome Sequence Analysis of a Human Papillomavirus 6 Isolate in Shandong Province,China |
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| ZHANG Cui,JI Feng,LIN Xiaojuan,KOU Zengqiang,XU Aiqiang,TAO Zexin,SONG Yanyan. Complete Genome Sequence Analysis of a Human Papillomavirus 6 Isolate in Shandong Province,China[J]. Chinese journal of virology, 2021, 37(6): 1370-1375. DOI: 10.13242/j.cnki.bingduxuebao.003956 |
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| Authors: | ZHANG Cui JI Feng LIN Xiaojuan KOU Zengqiang XU Aiqiang TAO Zexin SONG Yanyan |
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