嗜酸氧化亚铁硫杆菌细胞色素C家族afe_0378基因转录表达差异及生物信息学挖掘 |
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引用本文: | 刘元东,郭淑慧,余润兰.嗜酸氧化亚铁硫杆菌细胞色素C家族afe_0378基因转录表达差异及生物信息学挖掘[J].微生物学杂志,2014(2):7-11. |
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作者姓名: | 刘元东 郭淑慧 余润兰 |
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作者单位: | 中南大学资源加工与生物工程学院生物冶金教育部重点实验室,湖南长沙410083 |
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基金项目: | 国家自然科学基金(51274268,50904080);国家“973计划”项目(2010CB630900);中国博士后科学基金(2013M540643) |
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摘 要: | 嗜酸氧化亚铁硫杆菌是一种极为重要的浸矿微生物,具有氧化各种还原性含硫物及亚铁等功能。采用实时荧光定量PCR技术及生物信息学等手段对该菌一个涉及铁硫氧化由afe_0378基因编码的细胞色素C家族蛋白CycA2进行了研究。结果表明,afe_0378基因在单质硫培养条件下转录水平是亚铁培养条件下的2.67倍。生物信息学分析表明afe_0378编码蛋白CycA2是分子质量为22.959 ku,pI为9.75的结合内膜的周质蛋白,二级结构为全α-螺旋,无β-折叠,包含2个相似结构域及N端一段跨膜疏水螺旋,属于细胞色素C4型蛋白家族。CycA2蛋白分子三维结构模建表明,双血红素与CycA2蛋白序列片段域C48-X-X-C51-H52及C149-X-X-C152-H153中的半胱氨酸共价连接。结合该菌硫代谢背景知识,推测CycA2蛋白的功能是介导细胞色素bc1复合体及终端氧化酶细胞色素aa3复合体之间的电子传递而参与硫代谢。
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关 键 词: | 嗜酸氧化亚铁硫杆菌 细胞色素C4型蛋白 实时荧光定量PCR 生物信息学 |
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