用计算机折叠蛋白质:我们走了多远?(英文) |
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引用本文: | 雷红星,段勇.用计算机折叠蛋白质:我们走了多远?(英文)[J].生物物理学报,2011(3). |
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作者姓名: | 雷红星 段勇 |
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作者单位: | 中国科学院北京基因组研究所;UC Davis Genome Center and Department of Applied Science;华中科技大学物理学院; |
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基金项目: | NIH(GM79383,GM67168); 国家自然科学基金项目(30870474); 留学回国人员基金项目~~ |
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摘 要: | 蛋白质折叠是现代科学最具挑战性的难题之一。Anfinsen的先驱性工作已经过去数十年了,我们对蛋白质折叠的机理仍不甚了然。但值得庆幸的是,科学工作者们在解析几个模型蛋白质的折叠机理上已经取得了明显的进展。这篇综述将主要回顾在蛋白质折叠的计算研究方面的进展。受益于计算机技术的迅猛发展,在1998年首次实现了一个微秒的全原子水平的蛋白质折叠,从2000年开始,folding@home将全球分布式计算技术应用于蛋白质折叠。在经历了数十年艰苦的努力之后,天然蛋白质亚埃精度的折叠终于在2007年成功实现。近年来,一种全新的概念开始出现,人们越来越多地用网络来解释蛋白质折叠的机理。随着分子力场的不断完善,分子模拟将会在解析蛋白质折叠的机理上起到越来越重要的作用。
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关 键 词: | 蛋白质折叠 分子动力学 折叠路径 折叠地形 折叠网络 |
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