| 结合基因表达数据和ChIP-chip数据的酵母转录调控模块的识别 |
| |
| 引用本文： | 王晓敏,王正志,王广云,黎刚果. 结合基因表达数据和ChIP-chip数据的酵母转录调控模块的识别[J]. 生物物理学报, 2011, 0(3) |
| |
| 作者姓名： | 王晓敏 王正志 王广云 黎刚果 |
| |
| 作者单位： | 国防科技大学机电工程与自动化学院; |
| |
| 基金项目： | 国家自然科学基金项目(60835005); 国防科大科研计划项目(JC09-03-04) |
| |
| 摘 要： | 活细胞依赖其众多的转录调控模块来实现复杂的生物功能,识别转录调控模块对深入理解细胞的功能及其转录机制有着重要的意义。本文结合酵母基因表达数据和ChIP-chip数据,提出了一种转录调控模块识别算法。该算法通过采用不同的P值阈值分别得到了核心集和粗糙集,然后对核心集和粗糙集进行判别,最后对基因进行扩展之后得到基因转录调控模块。将该算法运用到两个酵母基因表达数据中,得到了一些具有显著生物学意义的基因转录调控模块。与其它算法相比,该算法不仅可以识别含有较多基因的转录调控模块,而且可以识别一些其它算法不能识别的基因转录调控模块。识别得到的基因转录调控模块有着不同的生物学功能,并且有助于进一步理解酵母的转录调控机制。
|
| 关 键 词： | 基因表达数据 ChIP-chip数据 转录调控模块 调控因子 酵母 |
Yeast Transcriptional Regulatory Module Identification by Integrating Gene Expression Data and ChIP-chip Data |
| |
| WANG Xiaomin,WANG Zhengzhi,WANG Guangyun,LI Gangguo Institute of Automation,National University of Defense Technology,Changsha ,China. Yeast Transcriptional Regulatory Module Identification by Integrating Gene Expression Data and ChIP-chip Data[J]. Acta Biophysica Sinica, 2011, 0(3) |
| |
| Authors: | WANG Xiaomin WANG Zhengzhi WANG Guangyun LI Gangguo Institute of Automation National University of Defense Technology Changsha China |
| |
| Affiliation: | WANG Xiaomin,WANG Zhengzhi,WANG Guangyun,LI Gangguo Institute of Automation,National University of Defense Technology,Changsha 410073,China |
| |
| Abstract: | |
| |
| Keywords: | |
| 本文献已被 CNKI 等数据库收录！ |
|
