| 基于甲基化组学数据建立并验证肝细胞癌预后评价模型研究 |
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| 作者姓名： | 李冠群 梁超杰 夏峰 |
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| 作者单位： | 1. 首都医科大学附属北京同仁医院普外科;2. 山西医科大学第一医院肝胆胰外科 |
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| 基金项目： | 山西省应用基础研究计划项目（201901D211480）； |
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| 摘 要： | 利用甲基化CG位点建立并验证肝细胞癌（hepatocellular carcinoma,HCC）预后相关模型是当前的研究热点。利用R语言平台分析肝癌基因组图谱数据库（TCGA-LIHC）和基因表达综合数据库（GSE136380）甲基化组学数据，采用limma包分析TCGA-LIHC和GSE136380数据差异甲基化CG位点，采用wgcna包对GSE136380进行加权基因共表达网络分析，确定三者交集为关键甲基化CG位点集，共获得83个甲基化CG位点。利用LASSO-COX风险比例回归分析筛选出6个甲基化CG位点，包括cg15744128、cg24282479、cg17922226、cg13090969、cg23505966和cg08708079，构建并验证HCC外科切除术后的预后模型。拟合模型在训练集中1、3和5年的AUC分别是0.756(95%CI:0.644～0.876)、0.749(95%CI:0.638～0.854)和0.797(95%CI:0.661～0.920)；测试集中1、3和5年的AUC分别为0.848(95%CI:0.680～0.990)、0.833(95%CI:0....
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| 关 键 词： | 肝细胞癌 公共数据库 预后评价 甲基化 列线图 |
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