A/H7N9流感病毒神经氨酸酶进化分析 |
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引用本文: | 孙一桐,金能智,张海蓉,沈玉琳,马尧,彭天蜀.A/H7N9流感病毒神经氨酸酶进化分析[J].病毒学报,2014(1). |
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作者姓名: | 孙一桐 金能智 张海蓉 沈玉琳 马尧 彭天蜀 |
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作者单位: | 甘肃省云计算重点实验室甘肃省计算中心; |
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基金项目: | 甘肃省重点实验室建设计划(NO.1106RTSA021);甘肃省2012年陇原青年创新人才扶持计划 |
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摘 要: | 世界卫生组织报道2013年在中国出现首例人感染H7N9流感病毒病例,这在我国一定的范围内造成了危害,引起了恐慌,因此利用生物信息技术对其进行研究显得十分必要。神经氨酸酶NA是流感病毒最重要的抗原之一,也是抗流感药物的重要作用靶点。从美国国家生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information,NCBI)数据库下载A/H7N9流感病毒NA基因核酸序列及其编码蛋白序列,利用MEGA5.0软件对核苷酸编码序列构建系统进化树,利用BioEdit软件进行比对,分别作核苷酸与氨基酸同源性计算,继而分析NA基因重要位点变异情况,结果显示H7N9流感病毒传播呈现一定的地域关系和时间关系,2013年流行的中国的毒株属于亚欧型,其NA茎区发生了比较明显的变异,这也许是该病毒感染人类的原因之一。这些分析结果对于研究H7N9流感病毒基因的进化关系和变异趋向具有重要的参考价值。
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关 键 词: | 流感病毒 HN 神经氨酸酶 进化树 |
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