| 人类和模式生物标准转录数据库Web服务系统"StdTransDb"的技术实现 |
| |
| 引用本文： | 王小磊,赵东升,李稚锋,杭兴宜,骆志刚,张成岗.人类和模式生物标准转录数据库Web服务系统"StdTransDb"的技术实现[J].生物信息学,2007,5(4):163-166. |
| |
| 作者姓名： | 王小磊 赵东升 李稚锋 杭兴宜 骆志刚 张成岗 |
| |
| 作者单位： | 1. 军事医学科学院卫生勤务与医学情报研究所,北京,100850
2. 军事医学科学院放射与辐射医学研究所,北京,100850
3. 国防科技大学并行与分布处理国防科技重点实验室,长沙,410073 |
| |
| 基金项目： | 国家重点基础研究发展计划(973计划);国家高技术研究发展计划(863计划);国家自然科学基金;国防科技重点实验室基金;北京市"科技新星计划";军事医学科学院科研项目 |
| |
| 摘 要： | 以RefSeq数据库和已测序基因组序列为模板,通过大规模计算得到代表转录各层次信息的"标准转录数据库",并利用通用网关接口技术,建立了人类和模式生物标准转录数据集Web服务系统。用户提交RefSeq记录号或自由注释词,可检索获得序列的全部信息,实现对基因结构解析的在线计算。目前系统覆盖了人、拟南芥、水稻、大鼠、小鼠、斑马鱼等6个物种,拥有数据记录18万余条。为深入研究人类及其他物种转录组提供了重要工具,并为进一步分析真核基因的可变剪接方式提供了坚实的数据基础。
|
| 关 键 词： | 转录组学 可变剪接 预计算 存储优化 Web服务 |
| 文章编号： | 1672-5565（2007）-04-163-04 |
| 收稿时间： | 2006-11-02 |
| 修稿时间： | 2007-01-10 |
| 本文献已被 CNKI 维普 万方数据 等数据库收录！ |
|
