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鲤脑组织低温差异表达候选基因的筛选
引用本文:Xu LH,Chang YM,Liu CL,Liang LQ,Liu JL,Chi BJ. 鲤脑组织低温差异表达候选基因的筛选[J]. 遗传, 2011, 33(3): 262-269. DOI: 10.3724/SP.J.1005.2011.00262
作者姓名:Xu LH  Chang YM  Liu CL  Liang LQ  Liu JL  Chi BJ
作者单位:1. 中国水产科学院黑龙江水产研究所,哈尔滨,150070;上海海洋大学水产与生命学院,上海,201306
2. 中国水产科学院黑龙江水产研究所,哈尔滨,150070
基金项目:国家重点基础研究发展计划“973计划”项目(编号:2010CB126305); 农业部水产生物技术重点开放实验室项目(编号:2009NYBZS-05); 中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金项目(编号:2009HSYZX-SJ-05)资助
摘    要:采用双标准曲线相对实时荧光定量PCR法,分别以23℃常温对照组和6℃低温待测组的黑龙江鲤脑组织cDNA为模板,以18S rRNA为内参基因,检测26个候选基因的相对表达量。实验数据经显著性分析发现,有5个候选基因在低温条件下表达量显著上升(P<0.01),与对照组相比它们的表达量分别上升了2.11倍、13.9倍、2.52倍、7.38倍和1.83倍,基因功能比对结果表明其编码蛋白产物分别是脂肪酸链延伸蛋白、酰基辅酶A脱氢酶、转录起始因子IIB、肌醇-1-磷酸合成酶、血脑屏障HT7抗原;有7个候选基因在低温下表达量分别下降了21.8%、25.9%、16.6%、23.7%、15.8%、16.3%、42.5%,但对照组和待测组差异不显著(P>0.05),基因功能比对发现它们主要参与抑制糖酵解,促进细胞凋亡和干扰神经系统的重塑活动。上述低温下表达量显著上升的5个冷诱导候选基因的获得为今后进行不耐低温鱼类的基因工程育种提供了基因元件。

关 键 词:  脑组织cDNA  低温  候选基因  实时荧光定量PCR  双标准曲线法

Screening cold-acclimation differential expression candidate genes in the brain of common carp (Cyprinus carpio)
Xu Li-Hua,Chang Yu-Mei,Liu Chun-Lei,Liang Li-Qun,Liu Jin-Liang,Chi Bing-Jie. Screening cold-acclimation differential expression candidate genes in the brain of common carp (Cyprinus carpio)[J]. Hereditas, 2011, 33(3): 262-269. DOI: 10.3724/SP.J.1005.2011.00262
Authors:Xu Li-Hua  Chang Yu-Mei  Liu Chun-Lei  Liang Li-Qun  Liu Jin-Liang  Chi Bing-Jie
Affiliation:XU Li-Hua1,2,CHANG Yu-Mei1,LIU Chun-Lei1,LIANG Li-Qun1,LIU Jin-Liang1,CHI Bing-Jie1,2 1.Heilongjiang River Fisheries Research Institute,Chinese Academy of Fishery Sciences,Harbin 150070,China,2.College of Fisheries and Life Sciences,Shanghai Ocean University,Shanghai 201306
Abstract:
Keywords:Cyprinus carpio  brain cDNA  low temperature  candidate genes  real-time quantitative PCR  double-standard curves  
本文献已被 CNKI 万方数据 PubMed 等数据库收录!
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