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中国壮族和裕固族群体HLAⅠ类区域Alu插入多态性及其与HLA-A位点的相关性
引用本文:史磊,姚宇峰,史荔,陶玉芬,于亮,黄小琴,林克勤,易文,孙浩,杨昭庆,褚嘉祐.中国壮族和裕固族群体HLAⅠ类区域Alu插入多态性及其与HLA-A位点的相关性[J].遗传,2011,33(2):138-146.
作者姓名:史磊  姚宇峰  史荔  陶玉芬  于亮  黄小琴  林克勤  易文  孙浩  杨昭庆  褚嘉祐
作者单位:中国医学科学院北京协和医学院医学生物学研究所遗传室, 昆明 650118
基金项目:云南省应用基础研究重点项目(编号:2008CC021); 国家自然科学基金项目(编号:30900798)资助
摘    要:近年来研究发现: 位于HLAⅠ类基因区域的Alu插入是研究不同群体HLAⅠ类基因区域祖先单倍型和HLAⅠ类基因多样性产生、进化和重组的理想工具。文章对中国壮族和裕固族群体HLAⅠ类基因区域5个Alu插入多态性(AluMICB、AluTF、AluHJ、AluHG和AluHF)进行研究, 结合HLA基因分型数据, 分析壮族、裕固族、哈尼族、布朗族和傣族5个民族群体中Alu插入与HLA-A等位基因的关系。研究结果显示: (1)壮族和裕固族人群中5个Alu插入频率范围分别为1.5%~35.8%和9.2~34.8%, AluMICB、AluTF和AluHF插入频率在这两个群体中有统计学差异(P<0.05); (2)在5个研究的群体中, AluHG插入与HLA-A*02的不同亚型关联; AluHJ插入与HLA-A*2402在5个群体中都关联, 但AluHJ与HLA-A*1101和HLA-A*2407只在布朗族中关联。表明不同群体HLAⅠ类基因区域内Alu插入具有各自的特征, 且Alu插入与不同的HLA-A等位基因相关联。这种Alu插入及其与HLA-A的关联特征可作为研究群体中HLAⅠ类基因和单倍型系谱变化的重要遗传标记。

关 键 词:HLAⅠ类基因  Alu插入  祖先单倍型  
收稿时间:2010-04-15
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