| cDNA微阵列结合抑制性差减杂交研究对虾白斑综合征病毒部分表达基因 |
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| 引用本文： | 曾勇,陆承平.cDNA微阵列结合抑制性差减杂交研究对虾白斑综合征病毒部分表达基因[J].病毒学报,2004,20(3):255-260. |
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| 作者姓名： | 曾勇 陆承平 |
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| 作者单位： | 南京农业大学,动物医学院,江苏,南京,210095;中国水产科学研究院,长江水产研究所,湖北,荆州,434000;南京农业大学,动物医学院,江苏,南京,210095 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金，瑞典国际科学基金 |
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| 摘 要： | 通过抑制性差减杂交技术建立了包含对虾白斑综合征病毒表达性基因的差减文库,并用cDNA微阵列技术进行了鉴定,得到255个正向克隆.对其中的184个正向阳性克隆进行了测序,测序结果通过BLAST与GenBank中序列进行比对,共得到WSSV(white spot syndrome virus,WSSV)基因30个.此次首次鉴定了5个,其中WSV184具有调控蛋白的结构特征(Cys2/Cys2型锌指),WSV321和WSV322含跨膜结构,且存在可能的糖基化位点.有3个被其它研究推断无polyA结构的阅读框所处的mRNA应有polyA结构.进一步用Dot Northern blot对克隆号PCI118(含WSSV阅读框WSV321和WSV322)进行鉴定,表明确实存在该基因的转录.进而根据已报道的WSSV基因序列设计两条引物,用快速扩增cDNA末端技术,扩增WSV321和WSV322两个阅读框所处的cD-NA的5′端片段和3′端片段,分析得到其全长共1 109bp,与已报道的WSSV全基因序列(AF332093)的相关序列完全相同.该mRNA存在polyA,并有加尾信号AATAAA;两个阅读框都没有自己的TATA盒,但都有病毒RNA聚合酶Ⅱ的结合位点-CCAAT盒;它们编码的蛋白质分别有117和227个氨基酸,都存在可能的糖基化位点,其中WSV321一个,WSV322两个.
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| 关 键 词： | 对虾白斑综合征病毒 表达基因 斑点杂交 快速扩增cDNA末端 |
| 文章编号： | 1000-8721(2004)03-0255-06 |
Analysis of Partial Expressed Genes of Penaeid Shrimp White Spot Syndrome Virus with Suppression Subtractive Hybridization and cDNA Microarray |
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| ZENG Yong.Analysis of Partial Expressed Genes of Penaeid Shrimp White Spot Syndrome Virus with Suppression Subtractive Hybridization and cDNA Microarray[J].Chinese Journal of Virology,2004,20(3):255-260. |
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| Authors: | ZENG Yong |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | white spot syndrome virus expressed gene Dot Northern blot rapid amplification of cDNA end |
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