| 杧果Whirly基因鉴定及其在病菌侵染过程中的表达分析 |
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| 引用本文： | 孙 宇,刘志鑫,叶 子,罗睿雄,蒲金基,张 贺.杧果Whirly基因鉴定及其在病菌侵染过程中的表达分析[J].西北植物学报,2021,41(1):37-45. |
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| 作者姓名： | 孙 宇 刘志鑫 叶 子 罗睿雄 蒲金基 张 贺 |
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| 作者单位： | (1 海南大学 植物保护学院，海口 570228；2 中国热带农业科学院环境与植物保护研究所/农业农村部热带作物有害生物综合治理重点实验室，海口 571101；3 中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所，海口571101) |
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| 基金项目： | 国家重点研发专项(2019YFD1000504)； |
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| 摘 要： | Whirly家族是一类植物特异的转录因子,无论在细胞核还是在细胞器内都有着广泛而复杂的生物学功能。该研究以杧果全基因组数据为基础,采用生物信息学的方法对杧果Whirly家族基因进行序列分析,并通过qRT-PCR技术分析杧果胶孢炭疽菌(Colletotrichum gloeosporioides,Cg)和细菌性黑斑病菌(Xanthomonas campestris pv.mangiferaeindicae,Xcm)侵染过程中杧果Whirly家族基因的相对表达量。结果表明:(1)从杧果基因组中鉴定了3个Whirly基因家族成员,分别命名为MiWHY1、MiWHY2和MiWHY3。(2)杧果Whirly蛋白均为不稳定亲水碱性蛋白;系统发育树显示,杧果Whirly基因与木薯、毛果杨、番茄Whirly基因亲缘关系最近,杧果与木薯、毛果杨、番茄Whirly家族共有1个高度保守的基序Motif1;杧果Whirly家族均含有Whirly超家族保守域,主要结构元件为无规则卷曲和α-螺旋;保守结构域的四聚体结构与马铃薯Whirly蛋白四聚体结构具有高度相似性。(3)qRT-PCR结果显示,Cg侵染过程中,杧果Whirly基因的相对表达量均显著上调;Xcm侵染12 h时,MiWHY1和MiWHY3相对表达量显著上调,初步确定杧果Whirly基因表达响应胶孢炭疽菌和细菌性黑斑病菌的侵染。研究认为,杧果中有3个Whirly基因家族成员,病菌侵染过程中可激发其表达活性,为后续研究杧果Whirly基因家族成员的功能和机制奠定基础。
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| 关 键 词： | 杧果 Whirly基因家族 全基因组鉴定 表达分析 |
Identification of Mango Whirly Gene and Its Expression Analysis in the Pathogen Infection |
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| SUN Yu,LIU Zhixin,YE Zi,LUO Ruixiong,PU Jinji,ZHANG He.Identification of Mango Whirly Gene and Its Expression Analysis in the Pathogen Infection[J].Acta Botanica Boreali-Occidentalia Sinica,2021,41(1):37-45. |
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| Authors: | SUN Yu LIU Zhixin YE Zi LUO Ruixiong PU Jinji ZHANG He |
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| Institution: | (College of Plant Protection, Hainan University, Haikou 570228, China;2Environment and Plant Protection Institute, Chinese Academy of Tropical Agricultural Sciences/Key Laboratory of Integrated Pest Management on Tropical Crops, Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Haikou 571101, China;3Tropical Crops Genetic Resources Institute, Chinese Academy of Tropical Agricultural Sciences, Haikou 571101, China) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | mango Whirly gene family genomic identification expression analysis |
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