| 全基因组关联研究中的交互作用研究现状 |
| |
| 作者姓名： | Li FG Wang ZP Hu G Li H |
| |
| 作者单位： | 1. 东北农业大学动物科学技术学院,哈尔滨,150030
2. 东北农业大学动物科学技术学院,哈尔滨 150030;中国水产科学研究院黑龙江水产研究所,哈尔滨 150070 |
| |
| 基金项目： | 国家高技术研究发展计划项目(863计划),现代农业产业技术体系专项,国家重点基础研究发展规划(973计划)项目 |
| |
| 摘 要： | 利用高密度单核苷酸多态(Single nucleotide polymorphism,SNP)标记在全基因组范围内检测影响复杂疾病/性状的染色体区段或基因,已经成为目前遗传学领域新的突破点之一。在全基因组关联研究(Genome-wide association study,GWAS)取得大量成果之后,研究者们对在全基因范围内研究交互作用产生了极大的热情。近几年,对交互作用的研究,无论是在方法的研发、实际的应用以及统计学上的交互向生物学上的交互转化,还是在信息组学的整合,都呈现快速发展的趋势。已有很多策略和方法被尝试用于进行全基因组交互作用分析,这些研究推动了对复杂疾病/性状遗传机制的进一步认识。基于目前全基因组交互分析所采用的各类数据处理方法的理论与算法的异同,文章拟对目前使用较为广泛的回归类方法、机器学习方法、贝叶斯模型法、SNP筛选类方法和基于并行程序的方法等5类方法加以评述,着重介绍了这些方法的算法原理、计算效率以及差别之处,以期能够为相关领域的研究者提供参考。
|
| 关 键 词： | 全基因组交互分析 复杂疾病/性状 统计方法 |
Current status of SNPs interaction in genome-wide association study |
| |
| Li FG,Wang ZP,Hu G,Li H.Current status of SNPs interaction in genome-wide association study[J].Hereditas,2011,33(9):901-910. |
| |
| Authors: | Li Fang-Ge Wang Zhi-Peng Hu Guo Li Hui |
| |
| Institution: | LI Fang-Ge1,WANG Zhi-Peng1,HU Guo1,2,LI Hui1 1.College of Animal Science and Technology,Northeast Agricultural University,Harbin 150030,China,2.Heilongjiang River Fishery Research Institute,Chinese Academy of Fishery Sciences,Harbin 150070 |
| |
| Abstract: | Identifying genetic variants associated with complex diseases/traits via genome-wide single nucleotide polymorphisms(SNPs) has proved to be a new and efficient method for studying genetics.With a large number of achievements of genome-wide association study(GWAS),researchers have focused on performing genome-wide SNPs interaction analysis.The search for interaction effects is marked by an exponential growth,not only in terms of methodological development,practical applications and translation of statistical... |
| |
| Keywords: | genome-wide SNPs interaction analysis complex diseases/traits statistical methods |
| 本文献已被 CNKI 万方数据 PubMed 等数据库收录！ |
|
