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用基因芯片结合荧光差异显示—PCR筛选和识别胃腺癌转移相关的基因
引用本文:王建华 陈诗书. 用基因芯片结合荧光差异显示—PCR筛选和识别胃腺癌转移相关的基因[J]. Acta biochimica et biophysica Sinica, 2002, 34(4): 475-481
作者姓名:王建华 陈诗书
作者单位:上海第二医科大学分子生物学实验室、人类基因治疗研究中心 上海200025(王建华),上海第二医科大学分子生物学实验室、人类基因治疗研究中心 上海200025(陈诗书)
摘    要:使用来源于同一个胃腺癌病人的原发灶RF-1(ATCC编号:CRL-1864)和转移灶RF-48细胞系(ATCC编号,CRL-1863)作为研究肿瘤转移分子机制的模型,RF-1(实验组)和RF-48(对照组)的mRNA通过逆转录方法,将Cy3和Cy5两种荧光染料分别标记到两种细胞的cDNA上,制备成cDNA探针,并与表达谱芯片(双点4096条基因)进行杂交与扫描,重复2次实验,利用计算机数据处理判断基因是否在上述两种细胞中有表达差异,共筛选出差异表达的基因共138条,其中81条在RF-48细胞中表达明显上调,57条在RF-48细胞中表达显著下调,同时也通过荧光差异显示-PCR(FDD-PCR)技术,克服了45个涉及胃腺癌转移相关基因,包括未被发现的基因3个,在两种筛选方法中都存在差异表达的基因共有7条,对部分可能与肿瘤志移机制有关的差异表达基因的作用进行了分析和讨论,基因芯片技术可高通量,大规模地研究基因表达水平,FDD-PCR技术可克隆出未发现的新基因,二者结合,初步筛选出与转移相关的基因,有助于揭示胃腺癌转移的分子机制。

关 键 词:基因芯片 荧光差异显示-PCR 筛选 识别 胃腺癌 转移相关基因

Screening and Identification of Gastric Adenocarcinoma Metastasis-related Genes by Using cDNA Microarray Coupled to FDD-PCR
WANG Jian Hua,CHEN Shi Shu. Screening and Identification of Gastric Adenocarcinoma Metastasis-related Genes by Using cDNA Microarray Coupled to FDD-PCR[J]. Acta biochimica et biophysica Sinica, 2002, 34(4): 475-481
Authors:WANG Jian Hua  CHEN Shi Shu
Affiliation:WANG Jian Hua,CHEN Shi Shu *
Abstract:
Keywords:cDNA chip  fluorescent differential display PCR  gastric adenocracinoma  metastasis related genes  
本文献已被 CNKI 维普 等数据库收录!
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