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茶树脯氨酸转运蛋白基因鉴定及表达分析
引用本文:代洪苇,周盈盈,郑姝婷,童华荣,袁连玉.茶树脯氨酸转运蛋白基因鉴定及表达分析[J].西北植物学报,2020,40(6):937-948.
作者姓名:代洪苇  周盈盈  郑姝婷  童华荣  袁连玉
作者单位:(1 西南大学 食品科学学院,重庆 400715;2 西南大学 食品科学与工程国家级实验教学示范中心,重庆 400715)
基金项目:国家自然科学基金(31400583);
摘    要:脯氨酸转运蛋白在植物体内脯氨酸的分配及响应多种非生物逆境胁迫过程中发挥着重要作用。为明确茶树体内脯氨酸转运蛋白家族情况,该研究从全基因组水平鉴定获得茶树脯氨酸转运蛋白家族成员,进行了系统进化关系、蛋白结构、基因表达特异性等分析。结果表明:(1)茶树中有6个脯氨酸转运蛋白基因,长度为1 326~1 725 bp之间,编码氨基酸数目在441~574 aa之间,蛋白质分子质量在48.5~63.0 kD之间,等电点为8.51~9.41,大部分为碱性蛋白,其结构中含有大量的α-螺旋和自由卷曲,少量的延长链和β-转角结构。(2)亚细胞定位分析结果显示,茶树CsProT1、CsProT2、CsProT4、CsProT5和CsProT6蛋白定位于细胞膜,CsProT3蛋白则定位于高尔基体。(3)CsProTs蛋白中含9~11个典型的跨膜结构域,其三级结构与保守基序特征均与拟南芥高度相似,具有高度的保守性,不同成员间氨基酸序列相似性达40.14%。(4)基因表达特异性分析显示,CsProT1,CsProT2和CsProT3基因在各个组织部位的表达量均较高,CsProT4、CsProT5和CsProT6表达量均较低,且CsProT1基因的表达量最高;除CsProT5基因外,CsProTs蛋白家族的基因均受到NaCl、干旱及冷胁迫的诱导表达。(5)蛋白相互作用分析结果显示,CsProTs蛋白可与脯氨酸氧化酶ERD5,脯氨酸生物合成限速酶P5CS1、P5CS2和δ-吡咯啉-5-羧酸脱氢酶ALDH12A1等脯氨酸合成,转运及降解有关的蛋白相互作用,共同调控茶树体内脯氨酸的含量。研究认为,茶树6个CsProTs蛋白可共同参与茶树体内脯氨酸的转运平衡及对多种非生物逆境胁迫响应的过程。

关 键 词:茶树  CsProTs    脯氨酸    全基因组鉴定  表达分析

Identification and Expression Profiling Analysis of CsProTs Gene Family in Tea Plant
DAI Hongwei,ZHOU Yingying,ZHENG Shuting,TONG Huarong,YUAN Lianyu.Identification and Expression Profiling Analysis of CsProTs Gene Family in Tea Plant[J].Acta Botanica Boreali-Occidentalia Sinica,2020,40(6):937-948.
Authors:DAI Hongwei  ZHOU Yingying  ZHENG Shuting  TONG Huarong  YUAN Lianyu
Abstract:
Keywords:tea plant  CsProTs  proline  genome identification  expression analysis
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