高粱磷脂酶D基因家族的鉴定和表达分析 |
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引用本文: | 张政,吕阳,韩少鹏,李森,罗霄天,刘莉敏,曾弓剑,郜新强,胡永峰,沈祥陵. 高粱磷脂酶D基因家族的鉴定和表达分析[J]. 生物资源, 2022, 0(6): 572-589 |
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作者姓名: | 张政 吕阳 韩少鹏 李森 罗霄天 刘莉敏 曾弓剑 郜新强 胡永峰 沈祥陵 |
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作者单位: | 1.三峡大学 三峡区域植物遗传与种质创新重点实验室/生物技术研究中心,湖北 宜昌 443000;2.安阳工学院,河南 安阳 455000 |
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基金项目: | 农业部华中作物有害生物综合治理重点实验室开放基金(2021ZTSJJ7) |
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摘 要: | 磷脂酶D(PLD)是植物生长和胁迫反应过程中参与膜磷脂分解代谢的关键酶。PLD编码基因在高等植物中构成了一个大的基因家族,但是仍未对高粱PLD基因家族进行深入研究。本研究中,通过全基因组分析,鉴定了15个PLD基因,并分成6个亚组,初步揭示了SbPLDs的基因结构、保守结构域、染色体定位和系统发育关系等信息。基因复制的研究表明,片段复制在高粱PLD基因家族的扩展中发挥了重要作用,SbPLDs在进化过程中经历了强烈的纯化选择。此外,转录组数据表明,受启动子区上游顺式元件调控的PLD家族基因可能在高粱的生长发育中发挥重要作用。通过real-time PCR分析,显示部分SbPLDs参与非生物胁迫和激素途径的潜力。亚细胞定位表明,高粱PLD蛋白在细胞质中富集,可能具有抗逆胁迫的功能。本研究为了解高粱PLD基因的特征提供了理论参考,为研究高粱PLD基因家族的进化提供了新的视角,也为阐明高粱PLD基因家族的功能提供了基础信息。
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关 键 词: | 高粱 磷脂酶D 基因复制 非生物胁迫 亚细胞定位 |
收稿时间: | 2022-09-14 |
修稿时间: | 2022-10-09 |
Identification and expression analysis of phospholipase D gene family in Sorghum bicolor |
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Abstract: | |
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Keywords: | Sorghum bicolor phospholipase D gene duplication abiotic stress subcellular localization |
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