| 柯萨奇病毒A组10型感染RD细胞的转录组学分析 |
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| 引用本文： | 江俊涛,任盈盈,刘洪波. 柯萨奇病毒A组10型感染RD细胞的转录组学分析[J]. 生物资源, 2023, 0(2): 185-192 |
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| 作者姓名： | 江俊涛 任盈盈 刘洪波 |
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| 作者单位： | 1.桂林医学院第二附属医院 广西糖脂代谢病重点实验室，广西 桂林 541199;2.桂林医学院 医学检验学院，广西 桂林 541199;3.武汉大学生命科学学院，病毒学国家重点实验室，湖北 武汉 430072 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金（81660280） |
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| 摘 要： | 探讨柯萨奇病毒A组10型（coxsackievirus A10, CV-A10）感染人横纹肌肉瘤（rhabdomyosarcoma,RD）细胞的基因表达谱变化，为深入理解CV-A10致病机制提供重要基础数据。本研究将CV-A10以感染复数（MOI）为0.1的剂量感染RD细胞12 h后提取总RNA，通过RNA-Seq技术获取RD细胞中的全部转录本信息，基于生物信息学的方法对差异表达基因进行GO(gene ontology, GO)和KEGG(Kyoto encyclopedia of genes and genomes, KEGG)分析。结果显示，共筛选到2 610个差异表达基因，其中表达上调的基因有1 582个，表达下调的基因有1 028个。随机选取8个差异表达基因，经RT-qPCR验证后发现，其变化趋势与转录组数据一致。GO和KEGG富集分析结果显示，差异表达基因主要聚焦于细胞内信号转导、mRNA加工、抗病毒免疫反应等过程。结果表明，CV-A10感染可能会引起RD细胞发生自噬。
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| 关 键 词： | 柯萨奇病毒A组10型 人横纹肌肉瘤细胞 转录组学 |
| 收稿时间： | 2023-03-24 |
| 修稿时间： | 2023-04-17 |
Transcriptomics analysis of RD cells infected with coxsackievirus A10 |
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| JIANG Juntao,REN Yingying,LIU Hongbo. Transcriptomics analysis of RD cells infected with coxsackievirus A10[J]. , 2023, 0(2): 185-192 |
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| Authors: | JIANG Juntao REN Yingying LIU Hongbo |
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