| 冰菜盐胁迫下的转录组分析 |
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| 引用本文： | 练冬梅,赖正锋,姚运法,林碧珍,洪建基. 冰菜盐胁迫下的转录组分析[J]. 热带亚热带植物学报, 2019, 27(3): 279-284 |
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| 作者姓名： | 练冬梅 赖正锋 姚运法 林碧珍 洪建基 |
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| 作者单位： | 福建省农业科学院亚热带农业研究所, 福建漳州 363005,福建省农业科学院亚热带农业研究所, 福建漳州 363005,福建省农业科学院亚热带农业研究所, 福建漳州 363005,福建省农业科学院亚热带农业研究所, 福建漳州 363005,福建省农业科学院亚热带农业研究所, 福建漳州 363005 |
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| 基金项目： | 福建省公益类科研院所专项（2018R1101025-2）资助 |
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| 摘 要： | 为了解冰菜(Mesembryanthemum crystallinum)叶片抗盐相关基因组学,利用Illumina Hi-seq TM2500高通量测序技术研究冰菜叶片在400 mmol L~(–1) NaCl胁迫下转录组基因的差异表达。结果表明,从400 mmol L~(–1) NaCl胁迫和对照的冰菜叶片中共获得13.01 Gb Clean data,Q30碱基均大于90.08%。共获得123个差异表达基因(DEGs),包括73个上调基因,50个下调基因,其中功能注释的基因有96个。根据Unigene库序列进行GO、COG和KEGG注释,筛选出8个与抗盐性相关差异表达基因,植物激素代谢相关基因,脱落酸8'-羟基化酶、吲哚-3-乙酰酸酰胺合成酶和茉莉酮酸酯ZIM结构域蛋白基因均下调表达,生长素响应蛋白、细胞分裂素合酶基因则上调表达,糖代谢相关基因棉子糖合成酶基因上调表达,质膜H+-ATPase基因上调表达,脱水蛋白基因下调表达。这为冰菜耐盐基因组学和分子生物学的研究奠定基础。
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| 关 键 词： | 冰菜 盐胁迫 叶片 转录组 差异表达基因 |
| 收稿时间： | 2018-07-16 |
Transcriptome Analysis of Mesembryanthemum crystallinum under Salt Stress |
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| LIAN Dong-mei,LAI Zheng-feng,YAO Yun-f,LIN Bi-zhen and HONG Jian-ji. Transcriptome Analysis of Mesembryanthemum crystallinum under Salt Stress[J]. Journal of Tropical and Subtropical Botany, 2019, 27(3): 279-284 |
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| Authors: | LIAN Dong-mei LAI Zheng-feng YAO Yun-f LIN Bi-zhen HONG Jian-ji |
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| Affiliation: | Subtropical Agriculture Research Institute, Fujian Academy of Agricultural Sciences, Zhangzhou 363005, Fujian, China,Subtropical Agriculture Research Institute, Fujian Academy of Agricultural Sciences, Zhangzhou 363005, Fujian, China,Subtropical Agriculture Research Institute, Fujian Academy of Agricultural Sciences, Zhangzhou 363005, Fujian, China,Subtropical Agriculture Research Institute, Fujian Academy of Agricultural Sciences, Zhangzhou 363005, Fujian, China and Subtropical Agriculture Research Institute, Fujian Academy of Agricultural Sciences, Zhangzhou 363005, Fujian, China |
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