山茶属植物ITS的扩增及其序列特征分析 |
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引用本文: | 尤欢,周阿涛,岳亮亮,寸东义,丁元明.山茶属植物ITS的扩增及其序列特征分析[J].植物研究,2014(3). |
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作者姓名: | 尤欢 周阿涛 岳亮亮 寸东义 丁元明 |
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作者单位: | 云南农业大学植物保护学院;云南出入境检验检疫局;昆明理工大学生命科学与技术学院; |
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基金项目: | 国家质检总局科技计划项目;云南出口花卉物种信息平台建立及分子生物学检测技术研究(2010IK273) |
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摘 要: | 以山茶属(Camellia)植物为实验材料,通过在PCR反应液中加入二甲基亚砜(DMSO)来改进ITS区的扩增效果,并对获得的序列进行了相关的比较分析以及系统发育分析。分析结果表明:(1)PCR反应液中添加4%的DMSO能明显提高ITS的扩增效率,并能有效防止ITS假基因的扩增;(2)与功能拷贝相比,ITS假基因序列的ITS1和ITS2区存在多处碱基缺失,GC含量明显偏低,5.8S区二级结构稳定性降低;(3)应用ITS假基因进行种水平的系统发育分析会对其真实的系统关系造成影响,提示进行系统进化研究时应警惕假基因的干扰。
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关 键 词: | DMSO ITS 山茶属 假基因 |
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