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基于COIND5序列的中国南部唇鱼骨和间鱼骨群体遗传结构
引用本文:蓝昭军,林龙峰,赵俊.基于COIND5序列的中国南部唇鱼骨和间鱼骨群体遗传结构[J].生态学杂志,2017,28(4):1377-1386.
作者姓名:蓝昭军  林龙峰  赵俊
作者单位:1.广州市亚热带生物多样性与环境生物监测重点实验室/广东省水产健康安全养殖重点实验室/广东省水产优质环保养殖工程技术研究中心/华南师范大学生命科学学院, 广州 510631 ;2.韶关市水产研究所/韶关市渔业技术推广站, 广东韶关 512006
基金项目:本文由国家自然科学基金项目(31372178)、公益性行业(农业)科研专项 (201303048)、广东省科技计划项目(2015A070706009)和国家科技基础条件平台工作重点项目(2005DKA21402)资助
摘    要:唇鱼骨和间鱼骨均为分布较广的初级淡水鱼类,是理想的亲缘地理研究材料;且两者形态特征较为相似,不易鉴别,故两者的分布记述和物种有效性存在争议.为了解我国南部唇鱼骨和间鱼骨的群体遗传结构并探讨两者的物种有效性,本研究对8条水系的唇鱼骨和9条水系的间鱼骨共130尾个体的COIND5基因序列片段进行了测定,并对这两个基因的组合序列(2151 bp)进行了分析.结果表明: 在130尾个体的COIND5基因组合序列中,共有196个核苷酸变异位点,共检测出50个单倍型,单倍型多样性为0.964,核苷酸多样性为0.019,遗传多样性较高.基于COIND5基因组合序列构建的 NJ 树显示,所有种群可分为两支,支系Ⅰ包含了韩江和九龙江的全部单倍型以及瓯江的部分单倍型,余下的单倍型组成了支系Ⅱ.两支系间的遗传距离为0.036,而唇鱼骨与间鱼骨之间的遗传距离为0.027.单倍型网络图表明,韩江、九龙江种群和其他水系种群分化较大;漠阳江种群由海南岛种群扩散而来;海南岛各种群及漠阳江种群的单倍型分支与珠江水系单倍型的分支之间的亲缘关系较近,与长江水系单倍型分支之间的亲缘关系则较远;湘江、桂江和柳江之间的亲缘关系较近.AMOVA分析结果显示,地理区之间的变异约占71.2%,地理区内种群间变异约占16.6%,种群内的变异占12.2%,表明其遗传分化主要来自地理区之间.错配分析及中性检验结果显示,全部种群、唇鱼骨种群、间鱼骨种群、支系Ⅰ和支系Ⅱ在历史上均没有发生过明显的扩张.

关 键 词:唇鱼骨  间鱼骨  遗传结构  遗传多样性  COI基因  ND5基因  中国南部
收稿时间:2016-07-05

Genetic structure of Hemibarbus labeo and Hemibarbus medius in South China based on mtDNA COI and ND5 genes
LAN Zhao-jun,LIN Long-feng,ZHAO Jun.Genetic structure of Hemibarbus labeo and Hemibarbus medius in South China based on mtDNA COI and ND5 genes[J].Chinese Journal of Ecology,2017,28(4):1377-1386.
Authors:LAN Zhao-jun  LIN Long-feng  ZHAO Jun
Institution:1.Guangzhou Key Laboratory of Subtropical Biodiversity and Biomonitor/Guangdong Provincial Key Laboratory for Healthy and Safe Aquaculture/Guangdong Provincial Engineering Technology Research Center for Environmentally-Friendly Aquaculture/School of Life Science, South China Normal University, Guangzhou 510631, China ;2. Shaoguan Fisheries Research Institute/Shaoguan Fishery Technical Extension Center, Shaoguan 512006, Guangdong, China
Abstract:
Keywords:Hemibarbus labeo  Hemibarbus medius  genetic structure  genetic diversity  COI gene  ND5 gene  South China
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