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百合斑驳病毒浙江分离物的基因组3′端序列分析
引用本文:刘文洪,洪健,陈集双,王冲,叶美琴.百合斑驳病毒浙江分离物的基因组3′端序列分析[J].微生物学报,2004,44(3):386-389.
作者姓名:刘文洪  洪健  陈集双  王冲  叶美琴
作者单位:1. 浙江大学生命科学学院,杭州,310029;浙江大学分析测试中心,杭州,310029
2. 浙江大学分析测试中心,杭州,310029
3. 浙江大学生命科学学院,杭州,310029
4. 浙江丽水市农业局,丽水,323000
基金项目:国家科技部农业科技成果转化专项 ( 0 2EFN2 13 3 0 0 2 69),浙江省科技厅项目 ( 2 0 0 2Z3 2 12 8)~~
摘    要:经RT-PCR扩增从浙江丽水的亚洲百合[Lilium cvs.(Asiatic Hybrids)]获得2个Potyvirus病毒分离物G和X的3′端cDNA片段,序列分析表明均为百合斑驳病毒(Lily mottle virus,LMoV);将12个来源于不同地区百合与郁金香上的Potyvirus分离物进行序列同源性比较和系统进化树分析,结果表明G、X、ML61、1229、2b、MD、HZ、J这8个分离物的CP核苷酸序列同源性达85.9%~100%,在进化树中聚集成簇,归为LMoV;2b2、TM和TBV1 3个分离物同源性达91.2%~99.3%,在进化树中也单独成簇,归为郁金香碎色病毒(Tulip breaking virus,TBV);2b3 与其它11个分离物同源性在74.4%~79.8%之间,为伦布兰特郁金香碎色病毒(Rembrandt tulip breaking virus,ReTBV)。Nib基因序列和3′UTR序列分析也表明G、X、ML61、1229、J、HZ这6个分离物之间亲缘关系较近,属于LMoV,而TM与它们的亲缘关系很远,属于TBV。LMoV分离物存在着两个群体,G和X分别处在第1群体和第2群体中,不表现地域相关性及寄主相关性。根据研究结果,将迄今世界各地侵染百合与郁金香的Potyvirus分离物归为LMoV、TBV和ReTBV 3个种。

关 键 词:百合斑驳病毒,郁金香碎色病毒,伦布兰特郁金香碎色病毒,亚洲百合,序列分析
文章编号:0001-6209(2004)03-0386-04
修稿时间:2003年12月9日
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