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| 基于DNA分子标记数据构建系统进化树的新策略 | |
| 引用本文： | 李亚玲,韩国民,何沙娥,张智俊.基于DNA分子标记数据构建系统进化树的新策略[J].生物信息学,2008,6(4):168-170. |
| 作者姓名： | 李亚玲 韩国民 何沙娥 张智俊 |
| 作者单位： | 1. 浙江林学院浙江省现代森林培育技术重点实验室,杭州,311300;浙江林学院农业与食品科学学院,杭州,311300 2. 南京大学生命科学学院,南京,210092 3. 浙江林学院浙江省现代森林培育技术重点实验室,杭州,311300 |
| 基金项目： | 浙江省森林培育重中之重学科开放课题，浙江林学院人才引进项目 |
| 摘 要： | 结合DPS软件和MEGA软件优点，进行DNA分子标记数据处理和系统发育树构建的新策略：首先使用DPS软件进行0，1数据系统聚类方法获得遗传距离矩阵，然后将此矩阵输入MEGA3，利用NJ或者UPGMA进行系统进化树的构建和树的优化。该方法操作简单，得到的树形美观。 |
| 关 键 词： | DPS MEGA DNA分子标记 进化树构建 |
A new strategy for construction of Phylogenetic tree based on DNA molecular mark data |
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| LI Ya-ling,HAN Guo-min,HE Sha-er,ZHANG Zhi-jun.A new strategy for construction of Phylogenetic tree based on DNA molecular mark data[J].China Journal of Bioinformation,2008,6(4):168-170. | |
| Authors: | LI Ya-ling HAN Guo-min HE Sha-er ZHANG Zhi-jun |
| Institution: | LI Ya - ling, HAN Guo - min, HE Sha - er, ZHANG Zhi - jun ( 1. Key lab for modern silviculture technology of ZheJiang province, ZheJiang Forestry College, Hartgzhou 311300, China; 2. College of life Science, NanJing University, NoJing 210092, China ; 3. School of Agriculture and food science , Zhejiang Forestry college, Hangzhou 3117190, China) |
| Abstract: | A new strategy was used for construction of Phylogenetic tree based on DNA molecular mark data by combined DPS statistic software and MEGA software. Firstly, computed phylogenetie distance matrix in DPS software from 0,1 data, and then imported the matrix into MEGA. Finally, phylogenetic tree was constructed by NJ/UPGMA methord. |
| Keywords: | DPS MEGA |
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