| 中国流行的狂犬病病毒时空进化分析 |
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| 引用本文： | 孟胜利,徐葛林,雷永良,吴杰,严家新,杨晓明.中国流行的狂犬病病毒时空进化分析[J].病毒学报,2011,27(3):231-237. |
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| 作者姓名： | 孟胜利 徐葛林 雷永良 吴杰 严家新 杨晓明 |
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| 作者单位： | 武汉生物制品研究所,武汉,430060;丽水市疾病预防控制中心,丽水,323000 |
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| 基金项目： | 国家863基金资助(2007AA022402) |
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| 摘 要： | 本研究对1931~2009年间分离于中国20个省区的167株狂犬病病毒的N基因序列进行进化分析,以探讨中国狂犬病病毒株的基因分型和分组情况、时间和空间的动态进化。结果显示:从中国分离的毒株都属于基因1型狂犬病病毒,可以分为2个进化分支共计8个组,分支Ⅰ包括1~4组,分支Ⅱ包括5~8组;选择压力分析表明中国狂犬病病毒处于较强的净化选择约束下,狂犬病病毒N基因中的核苷酸突变主要是同义突变;运用贝叶斯中的马尔科夫链的蒙特卡洛方法估计中国狂犬病病毒N基因核苷酸的平均碱基替代率为4×10-4替代/位点/年,共同祖先出现的时间不超过2000年前;迁移分析表明中国狂犬病病毒株存在跨地域传播。
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| 关 键 词： | 狂犬病病毒 分子流行病 N基因 地理 中国 生物信息学 |
Temporal and spatial population dynamics of rabies virus isolates in China |
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| Meng Sheng-Li,Xu Ge-Lin,Lei Yong-Liang,Wu Jie,Yan Jia-Xin,Yang Xiao-Ming.Temporal and spatial population dynamics of rabies virus isolates in China[J].Chinese Journal of Virology,2011,27(3):231-237. |
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| Authors: | Meng Sheng-Li Xu Ge-Lin Lei Yong-Liang Wu Jie Yan Jia-Xin Yang Xiao-Ming |
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| Institution: | MENG Sheng-li1,XU Ge-lin1,LEI Yong-liang2,WU Jie1,YAN Jia-xin1,YANG Xiao-ming1(1.Wuhan Institute of Biological Products,Wuhan 430060,China,2.Lishui Center for Disease Control and Prevention,Lishui 323000,China) |
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| Abstract: | In order to study phylogeography,population dynamics and molecular evolution of rabies viruses(RABVs) isolates from China,especially spatio-temporal dynamics,the timescale of RABVs evolution and its pattern of migration,we performed an extensive comparative analysis of RABV N gene sequence data,representing 167 isolates sampled from 20 provinces in a 78-year period(from 1931 through 2009).The available Chinese isolates could be divided into two distinct clades:Phylogroup clades I comprised Chinese group 1-4... |
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| Keywords: | rabies virus molecular epidemiology N gene geography China bioinformation |
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