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大豆BAC克隆基因注释
引用本文:王囡囡.大豆BAC克隆基因注释[J].生物技术通报,2010(12).
作者姓名:王囡囡
作者单位:黑龙江省农业科学院佳木斯分院,佳木斯,154007
基金项目:国家“863”计划(2006AA10Z1F4)
摘    要:根据来源于大豆BAC克隆库中的基因组序列,与其比对的基因或蛋白质序列可以从一些数据库中搜索,如GenBank序列数据库、EMBL数据库、PDB数据库等,然后利用NCBI的Entrz程序在数据库中搜索大豆基因类似物,获取其登录号及核苷酸序列,以及这些基因编码的氨基酸序列,通过GENSCAN等软件分析,得出的是与拟南芥等物种序列比对的结果,根据GENSCAN的预测结果,可以初步得知序列长度、基因数目及具有编码某种功能蛋白的基因存在的可能性,进而对预测出的氨基酸或核苷酸序列利用数据库NCBI中的BLAST进行序列的相似性搜索及比对分析,寻找其保守区域。最后对其功能基因进行注释。

关 键 词:大豆BAC克隆  序列比对  基因注释  

Gene Annotation of Soybean BAC Cloning
Wang Nannan.Gene Annotation of Soybean BAC Cloning[J].Biotechnology Bulletin,2010(12).
Authors:Wang Nannan
Institution:Wang Nannan(Jiamusi Branch of Heilongjiang Academy of Agricultural Sciences,Jiamusi 154007)
Abstract:
Keywords:Soybean BAC cloning Contrasting of sequence Gene annotation  
本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录!
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