| 基于转录组的池蝶蚌系统发育及其遗传分析 |
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| 引用本文： | 周伟,张万昌,周叶,王小敏,胡蓓娟,王军花,洪一江. 基于转录组的池蝶蚌系统发育及其遗传分析[J]. 水生生物学报, 2021, 45(3): 514-522. DOI: 10.7541/2021.2019.208 |
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| 作者姓名： | 周伟 张万昌 周叶 王小敏 胡蓓娟 王军花 洪一江 |
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| 作者单位： | 南昌大学生命科学学院江西省水产动物资源与利用重点实验室 |
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| 基金项目： | 国家贝类产业技术体系淡水珍珠贝养殖与育珠岗项目(CARS-49)；;国家自然科学基金(31660337)；;国家重点研发计划“蓝色粮仓科技创新”重点专项(2018YFD0901400)资助~~； |
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| 摘 要： | 池蝶蚌(Hyriopsis schlegelii)和三角帆蚌(Hyriopsis cumingii)的亲缘关系一直存在争议,为了更深入地对淡水珠蚌进行系统发育分析,研究对池蝶蚌及其3个近缘物种三角帆蚌、褶纹冠蚌(Cristaria plicata)和背角无齿蚌(Anodonta woodiana)的转录组进行了比较分析。对它们共有单拷贝同源基因进行多序列联配后计算这4种淡水珠蚌之间的遗传距离,结果表明池蝶蚌和三角帆蚌的遗传距离只有0.00746(小于1%),而其他淡水珠蚌之间的遗传距离几乎是它的10倍(平均大于6%)。系统发育分析表明,小方蚌亚科与无齿蚌亚科大约在5144万年前发生分歧,而池蝶蚌和三角帆蚌发生分化的时间大约在424万年前。进一步的遗传差异分析鉴定了池蝶蚌转录组中的特有基因,其中KEGG通路富集的结果表明这些基因主要富集在免疫细胞膜分子和蛋白消化吸收等通路上。同时, GO注释结果表明有很多特有基因与池蝶蚌的优良性状相关,如与发育相关的生长发育、系统发育和动物器官发育等生物学过程,及与免疫相关的免疫系统过程、抗原处理和呈递等生物学过程。以上结果表明,池蝶蚌和三角帆蚌具有更近...
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| 关 键 词： | 池蝶蚌 三角帆蚌 转录组 系统发育 遗传差异 |
| 收稿时间： | 2019-09-24 |
THE PHYLOGENY AND GENETIC ANALYSIS OF THE HYRIOPSIS SCHLEGELII BASED ON TRANSCRIPTOME |
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