基于转录组分析重金属镉对长茎葡萄蕨藻的影响 |
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引用本文: | 庞美霞,黄志立,刘小龙,唐勇军,李晓东,金刚.基于转录组分析重金属镉对长茎葡萄蕨藻的影响[J].应用生态学报,2021,32(12):4447-4456. |
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作者姓名: | 庞美霞 黄志立 刘小龙 唐勇军 李晓东 金刚 |
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作者单位: | 1.深圳职业技术学院博士后创新基地, 广东深圳 518055;2.深圳职业技术学院应用化学与生物技术学院, 广东深圳 518055 |
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基金项目: | 深圳职业技术学院博士后启动基金项目(6019330003K)和深圳市科技项目(JCYJ20170818140317993)资助 |
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摘 要: | 随着人类社会工业化进程的加快,重金属镉(Cd)污染对海洋生物的毒害作用突显。为了探索Cd胁迫下长茎葡萄蕨藻生理调控的分子响应机制,本文采用RNA-Seq技术对镉胁迫(Hcd2+)藻体组织转录组进行研究。结果表明: 与对照相比,Hcd2+组共筛选出差异表达基因(DEGs)702个,其中,257个基因上调表达,445个基因下调表达。对获得的DEGs进行功能注释及富集分析,发现长茎葡萄蕨藻的多种生物学功能受到Cd2+胁迫的影响,最终表现为抑制生长。GO富集分析发现,长茎葡萄蕨藻体内氧自由基的产生与清除出现失衡,并产生了DNA损伤等氧化伤害。KEGG富集分析发现,长茎葡萄蕨藻中多条与光合作用相关途径受到抑制,表明Cd2+胁迫导致长茎葡萄蕨藻的光合反应紊乱。
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关 键 词: | 长茎葡萄蕨藻 镉胁迫 分子机制 转录组 |
收稿时间: | 2021-02-05 |
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