| 线粒体基因组数据的分析方法和软件 |
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| 引用本文： | 李雪娟,杨婧,王俊红,任倩俐,李霞,黄原. 线粒体基因组数据的分析方法和软件[J]. 昆虫知识, 2013, 50(1) |
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| 作者姓名： | 李雪娟 杨婧 王俊红 任倩俐 李霞 黄原 |
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| 作者单位： | 陕西师范大学生命科学学院 西安710062 |
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| 摘 要： | 线粒体基因组的研究已经普及,其正确的拼接和注释是所有后续研究的基础。本文以Staden Package软件为主介绍了拼接和注释的线粒体基因组的方法,同时介绍了其他常用的拼接软件ContigExpress、DNAMAN、DNASTAR、BioEdit和Sequencher,以及利用不同软件(包括DOGMA、MOSAS、MITOS、GOBASE、OGRe、MitoZoa、tRNAscan-SE、ARWEN、BLAST和MiTFi等)对线粒体基因组中的蛋白质编码基因、rRNA、tRNA和A+T富集区进行注释的方法,最后介绍了利用MEGA5软件分析线粒体基因组的组成、Sequin软件提交序列和线粒体基因组数据绘图工具(CG view、MTviz和OGDRAW)。
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| 关 键 词： | 线粒体基因组 拼接 注释 |
Methods and software tools for mitochondrial genome assembly and annotation |
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