| 线粒体基因组测序策略和方法 |
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| 引用本文： | 沙淼,林立亮,李雪娟,黄原. 线粒体基因组测序策略和方法[J]. 昆虫知识, 2013, 50(1) |
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| 作者姓名： | 沙淼 林立亮 李雪娟 黄原 |
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| 作者单位： | 陕西师范大学生命科学学院 西安710062 |
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| 摘 要： | 本文综述了线粒体基因组测序策略和方法,在传统测序方法中介绍了基于物理分离线粒体DNA的克隆文库测序方法和基于PCR扩增产物的直接测序方法,后者重点介绍了基于长PCR扩增产物的引物步移法和基于总DNA的引物步移法;应用新一代高通量测序方法有基于总DNA样品的方法,包括需要预扩增mtDNA的多物种平行高通量和无需预扩增mtDNA的高通量方法,基于总RNA样品的转录组测序方法等。在实际工作中,选择哪种方法取决于研究规模、样品大小和保存状态、经费情况等。总的来说,基于长PCR扩增产物的引物步移法尤其适合小规模昆虫线粒体基因组研究,而对于大规模线粒体基因组研究来说,NGS技术无疑是省时省力的最佳选择。
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| 关 键 词： | 线粒体基因组 长PCR 引物步移法 高通量测序 |
Strategy and methods for sequencing mitochondrial genome |
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