| 棘孢木霉糖苷水解酶3基因家族的生物信息学及表达模式分析 |
| |
| 引用本文： | 李聪,王允.棘孢木霉糖苷水解酶3基因家族的生物信息学及表达模式分析[J].微生物学通报,2023,50(1):1-12. |
| |
| 作者姓名： | 李聪 王允 |
| |
| 作者单位： | 长江大学生命科学学院, 湖北 荆州 434025 |
| |
| 基金项目： | 国家自然科学基金(31601679) |
| |
| 摘 要： | 【背景】糖苷水解酶(glycoside hydrolase, GH) 3基因家族成员主要编码胞外β-葡萄糖苷酶，是纤维素降解中的关键酶。【目的】鉴定棘孢木霉GH3基因家族成员，探究其在纤维素降解过程中转录水平的表达模式。【方法】通过生物信息学方法对棘孢木霉GH3基因家族成员进行鉴定，对其基因结构、系统进化、蛋白理化性质、亚细胞定位及蛋白质三级结构进行分析，并采用荧光定量PCR技术对纤维素诱导下转录水平的表达模式进行综合分析。【结果】棘孢木霉基因组共鉴定到16个GH3基因家族成员，含有1-8个外显子，编码蛋白质长度为533-934个氨基酸，分子量为57.82-101.91 kDa，大多数为胞外蛋白。系统发育表明，该基因家族成员可分为4组，与里氏木霉的相似性较高。基因表达模式分析表明，纤维素诱导下，16个GH3基因均有表达，但不同成员在转录水平的表达存在差异。其中，1个基因呈组成型表达，2个基因表达下调，13个基因表达上调。棘孢木霉的胞外β-葡萄糖苷酶活力在纤维素诱导下明显提升，与GH3基因家族成员在转录水平的整体表达模式相一致。【结论】棘孢木霉基因组共包含16个GH3基因家族成员，而且多...
|
| 关 键 词： | 棘孢木霉 GH3基因家族 进化分析 纤维素降解 |
| 收稿时间： | 2022/5/12 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2022/6/29 0:00:00 |
Bioinformatics and expression analyses of glycoside hydrolase 3 genes in Trichoderma asperellum |
| |
| LI Cong,WANG Yun.Bioinformatics and expression analyses of glycoside hydrolase 3 genes in Trichoderma asperellum[J].Microbiology,2023,50(1):1-12. |
| |
| Authors: | LI Cong WANG Yun |
| |
| Institution: | College of Life Sciences, Yangtze University, Jingzhou 434025, Hubei, China |
| |
| Abstract: | |
| |
| Keywords: | Trichoderma asperellum GH3 gene family evolutionary analysis cellulose degradation |
|
| 点击此处可从《微生物学通报》浏览原始摘要信息 |
| 点击此处可从《微生物学通报》下载免费的PDF全文 |
|
