| 青藏高原戈壁生境中一株链霉菌新种Streptomyces haixigobicum sp. nov. Qhu-G9的多相分类学鉴定及其次级代谢产物的基因组挖掘 |
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| 引用本文： | 向信,殷恒霞,樊嘉凯,邓佳文,朱肇宇,邱庆辉,柳宇睿,张本印.青藏高原戈壁生境中一株链霉菌新种Streptomyces haixigobicum sp. nov. Qhu-G9的多相分类学鉴定及其次级代谢产物的基因组挖掘[J].微生物学通报,2023,50(5):1872-1886. |
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| 作者姓名： | 向信 殷恒霞 樊嘉凯 邓佳文 朱肇宇 邱庆辉 柳宇睿 张本印 |
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| 作者单位： | 青海大学生态环境工程学院, 青海 西宁 810016;青海大学三江源生态与高原农业国家重点实验室, 青海 西宁 810016 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(81760633)；生态学世界一流学科科技创新项目(2021-stxy-Y2)；生物技术一流专业科技创新项目(2022-stxy-B8， 2022-stxy-B9， 2022-stxy-B22) |
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| 摘 要： | 【背景】青藏高原极端生境具有丰富的微生物资源，同时也是微生物药物的重要来源，但是大量微生物新资源尚待开发利用。【目的】对从青藏高原戈壁土壤中分离得到的一株链霉菌Qhu-G9进行多相分类鉴定及次级代谢产物生物合成潜力分析。【方法】通过16S rRNA基因扩增、测序和系统发育分析，结合形态、生理生化、细胞化学组分及基因组测序等多相分类特征，确定链霉菌Qhu-G9的分类地位。【结果】Qhu-G9与链霉菌Streptomyces dioscori A217T和Streptomyces auranttiiacus NBRC 13017T相似度最高，均为99.22%，结合形态观察，说明该菌是一株链霉菌。基于16S rRNA基因序列构建的系统发育树显示Qhu-G9独立成支，并且其生理生化和细胞化学成分特征与最相似模式菌存在较大差异。通过基因组测序评估了与最相似模式菌的数字DNA-DNA杂交值(digital DNA-DNA hybridization,dDDH)和平均核苷酸一致性(average nucleotide identity,ANI)，发现Qhu...
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| 关 键 词： | 青藏高原 戈壁 链霉菌 多相分类学 生物合成基因簇 |
| 收稿时间： | 2023/1/9 0:00:00 |
Polyphasic identification and genome mining of secondary metabolites of a novel species Streptomyces haixigobicum sp. nov. Qhu-G9 isolated from the Gobi habitat of the Qinghai-Tibetan Plateau |
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| XIANG Xin,YIN Hengxi,FAN Jiakai,DENG Jiawen,ZHU Zhaoyu,QIU Qinghui,LIU Yurui,ZHANG Benyin.Polyphasic identification and genome mining of secondary metabolites of a novel species Streptomyces haixigobicum sp. nov. Qhu-G9 isolated from the Gobi habitat of the Qinghai-Tibetan Plateau[J].Microbiology,2023,50(5):1872-1886. |
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| Authors: | XIANG Xin YIN Hengxi FAN Jiakai DENG Jiawen ZHU Zhaoyu QIU Qinghui LIU Yurui ZHANG Benyin |
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| Institution: | College of Eco-environmental Engineering, Qinghai University, Xining 810016, Qinghai, China;State Key Laboratory of Plateau Ecology and Agriculture, Qinghai University, Xining 810016, Qinghai, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Qinghai-Tibet Plateau Gobi Streptomyces polyphasic taxonomy gene clusters for biosynthesis |
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