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基于全基因组的龟鳖目Hox基因序列特征及进化分析
作者姓名:黄保友  楼灵媛  樊嘉伟  孙伟  钱国英  葛楚天  王宗吉
作者单位:1. 上海海洋大学水产与生命学院;2. 浙江万里学院动物性别与发育重点研究所;3. 浙江万里学院生物与环境学院
基金项目:国家重点研发计划(2018YFD0900203);;国家自然科学基金(32102772);
摘    要:为对Hox基因在龟鳖目物种中进行系统地序列比较分析和进化研究,文章对目前具有染色体水平的龟鳖目基因组进行了Hox基因的鉴定,序列特征、进化和转录组分析。研究结果表明龟鳖物种的Hox基因簇是高度保守的。非重复序列的缺失导致鳖科HoxB9—HoxB13基因间区相对龟科短了10 kb。大量Hox基因编码区发生了鳖科或龟科特异的序列替换、插入和缺失。胸部骨骼发育相关的Hox基因在鳖科祖先发生了快速进化和受到正选择。Hox基因的表达具有组织、时期特异性,主要在胚胎时期的顶端外胚层嵴、背甲嵴和性腺表达。研究为龟鳖目Hox基因不同胚胎时期的多组学及表达调控分析提供了靶标,也为进一步厘清龟鳖物种演化创新提供了参考。

关 键 词:Hox基因  龟鳖目  演化  
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