基于转录组学分析大肠杆菌中purR基因缺失对胞苷合成代谢的影响

胞苷可作为功能营养化学品与药物合成原料，具有重要的应用价值。大肠杆菌中由purR基因编码的DNA结合转录抑制因子对胞苷合成代谢有重要调控作用。采用CRISPR/Cas9技术敲除大肠杆菌purR基因，并通过转录组学分析突变菌株基因表达的差异。结果表明，从出发菌株E.coli NXBG-12基因组上成功敲除了purR基因，获得了突变菌株E.coli NXBG-17P。对突变菌株E.coli NXBG-17P与E.coli NXBG-12的转录组学结果进行对比分析，发现有534个差异基因，其中上调基因302个、下调基因232个；GO分析显示，差异表达基因(DEGs)主要富集于细胞膜、ATP结合、DNA结合和水解酶活性的代谢过程；KEGG分析表明，上调基因主要富集在果糖和甘露糖代谢、嘧啶代谢和磷酸转移酶系统，下调基因主要富集在氧化磷酸化、半乳糖代谢和肽聚糖的生物合成。同时，突变菌株E.coli NXBG-17P在37℃摇瓶发酵40 h,测定胞苷浓度为(3.21±0.01) g/L,是出发菌株E.coli NXBG-12的1.58倍。这表明突变菌株E.coli NXBG-17P胞苷产量升高，可能...