基于转录组学分析大肠杆菌中purR基因缺失对胞苷合成代谢的影响 |
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作者姓名: | 马聪 张想军 叶彤 柳凤敏 张皓杰 刘慧燕 方海田 |
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作者单位: | 1. 宁夏大学食品与葡萄酒学院;2. 宁夏食品微生物应用技术与安全控制重点实验室 |
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基金项目: | 国家自然科学基金(31860020); |
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摘 要: | 胞苷可作为功能营养化学品与药物合成原料,具有重要的应用价值。大肠杆菌中由purR基因编码的DNA结合转录抑制因子对胞苷合成代谢有重要调控作用。采用CRISPR/Cas9技术敲除大肠杆菌purR基因,并通过转录组学分析突变菌株基因表达的差异。结果表明,从出发菌株E.coli NXBG-12基因组上成功敲除了purR基因,获得了突变菌株E.coli NXBG-17P。对突变菌株E.coli NXBG-17P与E.coli NXBG-12的转录组学结果进行对比分析,发现有534个差异基因,其中上调基因302个、下调基因232个;GO分析显示,差异表达基因(DEGs)主要富集于细胞膜、ATP结合、DNA结合和水解酶活性的代谢过程;KEGG分析表明,上调基因主要富集在果糖和甘露糖代谢、嘧啶代谢和磷酸转移酶系统,下调基因主要富集在氧化磷酸化、半乳糖代谢和肽聚糖的生物合成。同时,突变菌株E.coli NXBG-17P在37℃摇瓶发酵40 h,测定胞苷浓度为(3.21±0.01) g/L,是出发菌株E.coli NXBG-12的1.58倍。这表明突变菌株E.coli NXBG-17P胞苷产量升高,可能...
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关 键 词: | 大肠杆菌 胞苷 purR基因 基因敲除 转录组分析 |
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