| 基于rDNA ITS序列对绒泡菌目黏菌系统发育的探讨 |
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| 引用本文： | 李倩,闫淑珍,陈双林. 基于rDNA ITS序列对绒泡菌目黏菌系统发育的探讨[J]. 菌物学报, 2015, 34(3): 424-433 |
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| 作者姓名： | 李倩 闫淑珍 陈双林 |
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| 作者单位： | 南京师范大学生命科学学院 江苏南京210023 |
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| 摘 要： | 绒泡菌目Physarida是黏菌纲Myxogastria最大的一个目,对其系统发育关系的研究一直是根据形态特征。为了从分子水平探讨绒泡菌目乃至黏菌纲的系统发育关系,以黏菌r DNA ITS通用引物对绒泡菌目5属8种黏菌的r DNA ITS进行扩增和测序,结合Gen Bank中已有的黏菌r DNA ITS序列,利用贝叶斯推断法(Bayesian inference,BI)和最大似然法(Maximum likelihood,ML)构建系统发育树。结果表明:绒泡菌目不同物种的r DNA ITS区在碱基组成和长度上差异明显,长度为777–1 445bp,G+C mol%在53.4%–61.9%之间。绒泡菌目与发网菌目Stemonitida聚类为两个明显的分支,在绒泡菌目分支上,绒泡菌科Physaraceae和钙皮菌科Didymiaceae各聚为一支,支持了形态学上以孢丝是否具有石灰质为依据区分这两个科的观点。由多份不同地理来源的鳞钙皮菌Didymium squamulosum材料组成的钙皮菌科又形成3个分支,证实了这个形态种是由地域来源广泛、繁殖亲和性各异和遗传变异较大的不同生物种组成的复合体。
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| 关 键 词： | 黏菌 核糖体DNA内部转录间隔区 分子进化 最大似然法 贝叶斯分析 |
A phylogenetic study of Physarida based on rDNA ITS sequence |
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| LI Qian,YAN Shu-Zhen,CHEN Shuang-Lin. A phylogenetic study of Physarida based on rDNA ITS sequence[J]. Mycosystema, 2015, 34(3): 424-433 |
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| Authors: | LI Qian YAN Shu-Zhen CHEN Shuang-Lin |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | myxogastria rDNA ITS sequence molecular evolution maximum likelihood Bayesian inference |
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