一株Ⅱ型甲烷氧化菌中甲烷单加氧酶基因和16S rDNA的分析 |
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作者姓名: | 华绍烽 李树本 |
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作者单位: | 中国科学院兰州化学物理研究所,羰基合成与选择氧化国家重点实验室,兰州,730000 |
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摘 要: | [目的]利用分子生物学方法对-株甲烷氧化菌Methylosinus trichosporium IMV 3011中的16S rDNA和溶解性甲烷单加氧酶基因序列进行分析并探索其进化分类地位.[方法]利用基因数据库已有的基因序列信息,设计PCR扩增引物和基因测序引物,对溶解性甲烷单加氧酶基因和16s rDNA进行扩增和测序,并进行溶解性甲烷单加氧酶的6个基因和氨基酸序列与同类菌株的相应序列进行联配分析.[结果]获得了全长为5319 bp甲烷单加氧酶基因序列和长度为1290 bp的16S rDNA序列.该菌株与Methylosinus trichosporium OB3b中相对应基因的同一性是99.0%~82.7%,MMOX氨基酸序列的同一性为99.4%~81.8%,相似性为99.8%~89.2%.基于以上分析表明MMOX组分有很高的序列保守性,特别是在活性中心区域.[结论]菌株IMV3011属于甲基弯菌属,最近似的菌株是Methylosinus trichosporium OB3b.
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关 键 词: | 甲烷氧化菌 甲烷单加氧酶 基因测序 进化分析 |
收稿时间: | 2008-10-20 |
修稿时间: | 2008-11-21 |
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