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尼罗罗非鱼线粒体基因组全序列测定与系统进化分析
引用本文:杨丽萍,卢迈新,叶星,朱华平,高风英,莫媛媛,,黄樟翰.尼罗罗非鱼线粒体基因组全序列测定与系统进化分析[J].中国生物化学与分子生物学报,2010,26(5):484-490.
作者姓名:杨丽萍  卢迈新  叶星  朱华平  高风英  莫媛媛    黄樟翰
作者单位:中国水产科学研究院珠江水产研究所,广州510380;广东海洋大学水产学院,湛江524088
基金项目:国家科技支撑计划(No.2006BAD01A1201); 广东省农业重点项目(No.2009B020201003); “现代农业产业技术体系建设专项资金资助”(No.nycytx-48-4); 公益性行业(农业)科研专项(No.3-49); 广东省海洋渔业科技推广专项(No.A200899B02); 广东省重大科技兴渔项目(No.B200701A06)~~
摘    要:参照已报道的鱼类线粒体基因序列,通过PCR扩增与测序,获得了全长为16627bp的尼罗罗非鱼线粒体基因组全序列,共编码13种蛋白质基因、2种rRNA基因、22种tRNA基因和1段控制区序列.H-链碱基组成具有明显的AT偏向性.由H-链编码的蛋白质基因在第3位密码子上相对于前2个密码子具有一定的G排斥性.L-链编码蛋白质基因在碱基组成上与H-链编码基因存在差异.编码基因除COI以GTG作为起始密码子外,其它均以ATG起始.终止密码子有2种,分别为不完全T-或TA-和TAA.L-链复制起始区位于WANCY区域(tRNATrp-tRNAAla-tRNAAsn-tRNACys-tRNATyr)的tRNAAsn和tRNACys基因间,长度为33bp.系统发育分析显示,源于非洲的口孵鱼属、蓝首鱼属和球丽鱼属聚为单系群,其中口孵鱼属莫桑比克罗非鱼先与同属罗非鱼KM-2006聚类后再与尼罗罗非鱼聚类.

关 键 词:尼罗罗非鱼  线粒体基因组  丽鱼科  系统发育  
收稿时间:2009-12-3

Complete Mitochondrial Genome DNA of the Nile Tilapia Oreochromis niloticus and Phylogenetic Analysis
YANG Li-Ping,LU Mai-Xin,YE Xing,ZHU Hua-Ping,GAO Feng-Ying,
MO Yuan-Yuan,HUANG Zhang-Han
.Complete Mitochondrial Genome DNA of the Nile Tilapia Oreochromis niloticus and Phylogenetic Analysis[J].Chinese Journal of Biochemistry and Molecular Biology,2010,26(5):484-490.
Authors:YANG Li-Ping  LU Mai-Xin  YE Xing  ZHU Hua-Ping  GAO Feng-Ying  
MO Yuan-Yuan
    HUANG Zhang-Han
Institution:PearlRiverFisheriesResearchInstituteofChineseAcademyofFisherySciences,Guangzhou510380,China;FisheriesCollegeofGuangdongOceanUniversity,Zhanjiang524088,Guangdong,China
Abstract:
Keywords:
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