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人SDCT2基因的两种不同转录产物选择性转录机理分析
引用本文:白雪源,陈香美,侯剀,朱晗玉,邱强.人SDCT2基因的两种不同转录产物选择性转录机理分析[J].中国生物化学与分子生物学报,2004,20(5):615-622.
作者姓名:白雪源  陈香美  侯剀  朱晗玉  邱强
作者单位:中国人民解放军总医院,军医进修学院,全军肾病研究中心暨重点实验室,北京,100853
基金项目:国家重点基础研究发展规划项目 ( 973 ) (No.G2 0 0 0 0 5 70 0 3 ),国家自然科学基金 (No.3 0 0 70 2 88,No .3 0 12 10 0 5 ,No .3 0 2 70 5 0 5 )资助
摘    要:为了克隆人高亲和力钠离子依赖性二羧酸转运蛋白 (highaffinitysodium dependentdicarboxylatetransporter,SDCT2 ,或NaDC3)基因并研究其生理功能 ,用大鼠SDCT2基因序列作为电子杂交探针对人EST数据库进行电子筛选 ,得到了一系列与大鼠SDCT2序列具有高度同源性的人EST序列 ,将它们拼接成 2个基因重叠群 ,设计特异性PCR引物通过RT PCR扩增得到 2条杂交探针用于筛选人肾cDNA文库 .从肾组织中同时克隆出了人SDCT2基因 2种mRNA变异体的全长cDNA(SDCT2α和SDCT2 β) ,两者 5′端前 3435bp序列完全一致 ,但 3′端长度不同 ,SDCT2 β在第 3435bp以后比SDCT2α多出了 5 85bp的序列 .Northern杂交和RT PCR显示 ,SDCT2α在人肾中的表达丰度最高 ,在肝、脾、胎盘、脑及结肠中也有低水平的表达 .而SDCT2 β主要在肾脏中表达 ,在脾也有低水平的表达 .基因组结构分析表明 ,虽然两种mRNAs均由 13个外显子组成 ,但是SDCT2α的第 13外显子含有 1个poly(A)加尾信号AATAAA ,而SDCT2 β的第 13外显子含有 2个poly(A)加尾信号 .这表明在肾脏和脾脏组织中 ,人SDCT2基因可能通过选择性使用位于第 13外显子不同位置的 2个poly(A)信号而转录出 2种不同长度的mRNA变异体 .

关 键 词:SDCT2基因  选择性转录终止  选择性剪接  转录产物  变异体  
收稿时间:2004-10-20
修稿时间:2003年11月28
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