| 基于RNA-seq技术的青藏高原不同海拔水毛茛转录组测序及基因表达分析 |
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| 引用本文： | 陈飞飞,姬亚丽,陈忠海,刘泰龙,刘星.基于RNA-seq技术的青藏高原不同海拔水毛茛转录组测序及基因表达分析[J].植物科学学报,2021,39(1):50-58. |
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| 作者姓名： | 陈飞飞 姬亚丽 陈忠海 刘泰龙 刘星 |
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| 作者单位： | 1. 西藏大学理学院, 拉萨 850000;
2. 西藏大学青藏高原生态与环境研究中心极端环境生物适应 与进化实验室, 拉萨 850000;
3. 武汉大学生命科学学院, 武汉 430072 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目（31860046）。 |
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| 摘 要： | 以青藏高原不同海拔7个居群的水毛茛(Batrachium bungei(Steud.)L.Liou)为材料,对其进行转录组测序及基因表达分析,研究它们在极端环境下基因表达方面的适应性。结果显示,7个居群内样本间的基因表达具有较高的相似性。差异基因富集分析结果发现苯丙烷生物合成相关基因在5个差异组中均呈显著富集;此外类黄酮、类胡萝卜素、苯丙氨酸、酪氨酸、色氨酸的生物合成以及激素的信号转导、MAPK信号通路、植物与病原菌互作等相关基因大多被显著富集。与低海拔居群相比,参与类黄酮生物合成通路的相关基因(HHT1、HCT、F3′H、CHS、CYP73A、CCOAOMT5、CYP98A)在高海拔居群中均显著上调表达。研究结果表明水毛茛主要通过多途径的参与及关键基因的调控表达来适应青藏高原的高海拔环境。
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| 关 键 词： | 水毛茛 转录组测序 差异表达 富集分析 类黄酮 |
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