| Wolbachia pipientis wMel基因组水平上的密码子使用分析 |
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| 引用本文： | 孙铮,马亮,MURPHY Robert,张宪省,黄大卫.Wolbachia pipientis wMel基因组水平上的密码子使用分析[J].中国科学C辑,2009,39(10):948-953. |
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| 作者姓名： | 孙铮 马亮 MURPHY Robert 张宪省 黄大卫 |
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| 作者单位： | 山东农业大学植物保护学院;黄岛出入境检验检疫局;中国科学院动物研究所;Department;Natural;History;Royal;Ontario;Museum;Queen'sPark;Toronto;Canada;中国科学院昆明动物研究所遗传与进化国家重点实验室;山东农业大学生命科学学院; |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(批准号:30570970和30770302);;科学技术部科技基础性工作专项重点项目(批准号:2006FY110500);;国家基础科学人才培养基金(批准号:NSFC-J0630964/J0109)资助 |
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| 摘 要： | 本实验检测了黑腹果蝇的专性寄生菌Wolbachia pipientis wMel基因组的密码子使用模式，并推测影响其密码子组成的因素．选择了478条蛋白编码基因作为研究对象，它们的GC含量比较低，约0．282～0．432．本研究结果显示，关联突变（context-dependent mutation）是影响W.pipientis wMel基因组密码子组成的主要因素．同时，Nc—Plot曲线显示，基因组的密码子组成还受到了核苷酸组成偏好性（nucleotide composition bias）的影响．对应分析的结果显示，基因长度（R=0．123，P〈0．01）和基因表达水平（R=-0．312，P〈0．01）也对基因组的密码子使用偏好性起到了一定的作用．因此，关联突变、核苷酸组成、基因长度和基因表达水平都会影响到基因组的密码子使用偏好性．Wolbachia基因组的几个特征和动物线粒体基因组具有较高的相似性，而且现在已有报道说明它们有共同的起源，但仍需进一步验证．
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| 关 键 词： | Wolbaehia pipientis wMel 密码子使用 对应分析 关联突变 |
| 收稿时间： | 2009-07-15 |
| 修稿时间： | 2009-08-31 |
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