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应用cDNA微阵列技术筛选大鼠脊髓损伤修复相关基因
引用本文:Xiao L,Ma ZL,Li X,Lin QX,Que HP,Liu SJ. 应用cDNA微阵列技术筛选大鼠脊髓损伤修复相关基因[J]. 生理学报, 2005, 57(6): 705-713
作者姓名:Xiao L  Ma ZL  Li X  Lin QX  Que HP  Liu SJ
作者单位:军事医学科学院基础医学研究所神经生物学研究室,北京,100850;军事医学科学院基础医学研究所神经生物学研究室,北京,100850;军事医学科学院基础医学研究所神经生物学研究室,北京,100850;军事医学科学院基础医学研究所神经生物学研究室,北京,100850;军事医学科学院基础医学研究所神经生物学研究室,北京,100850;军事医学科学院基础医学研究所神经生物学研究室,北京,100850
基金项目:This work was supported by the National Science Foundation of China (No. 30200094), National Basic Research Priorities Programme of China (No.001CB510206),and National Key Project of Chinese Sanitation Miministries (No. WKZ-2001-1 - 18).
摘    要:脊髓损伤是一类常见的、高致残率的中枢神经系统疾病,由于多种复杂因素影响其损伤后的修复过程,损伤脊髓的再生能力非常有限。本研究采用cDNA微阵列技术筛选大鼠脊髓损伤后出现的差异表达基因。实验组动物在T8-T9进行脊髓全横断手术,对照组动物只打开椎板;4.5d后取脊髓进行RNA提取并在反转录过程中进行Cy3/Cy5标记,然后与预制的、带有4041条特异性探针的芯片进行杂交。Cy5/Cy3信号比值≥2.0视为脊髓损伤后出现差异表达的基因。通过筛选,我们得到了65个上调表达基因(21个已知基因,30个已知EST和14个未知基因)和79个下调基因(20个已知基因,42个已知EST和17个未知基因)。进一步通过半定量RT-PCR对其中的5个上调已知基因(Timpl,Tagln,Vim,Fc gamma receptor,Ctss)和三个下调已知基因(stearyl-CoA desaturase,F2,Ensa)的表达情况进行了验证,结果显示与芯片结果一致。这些基因可能在脊髓损伤后的修复过程中起一定的作用,对其深入研究将有助于揭示脊髓损伤修复的分子机制。

关 键 词:脊髓  基因表达  cDNA微阵列  反转录PCR
收稿时间:2005-05-31
修稿时间:2005-09-29

cDNA microarray analysis of spinal cord injury and regeneration related genes in rat
Xiao Lin,Ma Zhen-Lian,Li Xin,Lin Qiu-Xia,Que Hai-Ping,Liu Shao-Jun. cDNA microarray analysis of spinal cord injury and regeneration related genes in rat[J]. Acta Physiologica Sinica, 2005, 57(6): 705-713
Authors:Xiao Lin  Ma Zhen-Lian  Li Xin  Lin Qiu-Xia  Que Hai-Ping  Liu Shao-Jun
Affiliation:Department of Neurobiology, Institute of Basic Medical Sciences, Academy of Military Medical Sciences, Beijing 100850, China; E-mail: Liusj@nic.bmi.ac.cn.
Abstract:
Keywords:spinal cord   gene expression   cDNA microarray   RT-PCR
本文献已被 CNKI 维普 万方数据 PubMed 等数据库收录!
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