| FMDV OH99株基因组全序列的测定及其基因特征研究 |
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| 引用本文： | 刘光清,刘在新,张显升,常惠芸,郭慧琛,李冬,刘相涛,谢庆阁.FMDV OH99株基因组全序列的测定及其基因特征研究[J].中国病毒学,2003,18(3):259-264. |
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| 作者姓名： | 刘光清 刘在新 张显升 常惠芸 郭慧琛 李冬 刘相涛 谢庆阁 |
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| 作者单位： | 中国农业科学院兰州兽医研究所农业部畜禽疫病重点实验室,甘肃,兰州,730046 |
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| 基金项目： | 国家"973"项目资助(G1999011901) |
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| 摘 要： | 采用RT-PCR方法对FMDV OH99株基因组全序列进行了分子克隆与测序.结果表明OH99株基因组全基因组序列长8040nt,其中5'NCR长1026nt,前导蛋白(L)编码区长603nt.该毒株结构蛋白与非结构蛋白编码区的核苷酸序列为6318nt,3'NCR长93nt,其后是poly(A)尾巴,测序结果表明该结构至少含有56个A.应用分子生物学软件,将OH99株与其它参考毒株进行了序列比较,并对其基因特征、推导的氨基酸序列进行了研究分析.结果显示,在分类地位上OH99株归属于O型FMDV,与OTY TW/97具有较高的同源性,而与其他参考毒株的差异性比较大,而且在基因组功能未知区域和3A编码区域具有两处明显的基因片段缺失现象,其中3A编码区缺失30nt,与OTY TW/97株相同,但功能未知区域的缺失状况与OTY TW/97稍有差异.根据VP1基因序列,对OH99株与参考毒株进行了系统发生树分析,分析结果表明OH99株与OTY TW/97株在同一基因型内,其遗传关系最近,而与其毒株遗传关系较远.
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| 关 键 词： | FMDV OH99株 分子克隆 非编码区 结构蛋白 |
| 文章编号： | 1003-5125(2003)03-0259-06 |
| 修稿时间： | 2002年9月23日 |
The Sequence Analyses of Full-Length Genome of FMDV OH99 Strain |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | FMDV |
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