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| 隐马尔可夫模型-改进的预测蛋白质二级结构方法 | |
| 引用本文： | 石峰,莫忠息,张楚瑜.隐马尔可夫模型-改进的预测蛋白质二级结构方法[J].生物数学学报,2004,19(2):233-237. |
| 作者姓名： | 石峰 莫忠息 张楚瑜 |
| 作者单位： | 1. 华中农业大学,理学院,湖北,武汉,430070 2. 武汉大学,数学与统计学院,湖北,武汉,430072 3. 武汉大学,生命科学学院,湖北,武汉,430072 |
| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目(30170214) |
| 摘 要： | 引入蛋白质二级结构预测的新方法：隐马尔可夫模型，其中将蛋白质的二级结构分成三类：H(指α-螺旋)，E(β-折叠)及O(包括转角，卷曲及其结构)．该方法属于统计方法，但考虑了相邻氮基酸之间的相互作用(体现在状态传输概率)．通过模型的改进及参数的确定后，我们编制了程序HMMPS．用它来预测蛋白质二级结构，具有很高的准确度．其中关于H，F和O的准确率分别达到80．1％．72.0％和63．2％这表明．我们的方法是较为可靠的。 |
| 关 键 词： | 隐马尔可夫模型 Viterbi算法 二级结构预测 |
| 文章编号： | 1001-9626(2004)02-0233-05 |
| 修稿时间： | 2001年9月6日 |
HMM(Hidden Markov Models)-A New Method for Predicting Protein Secondary Structure |
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| SHI Feng MO Zhong-xi.HMM(Hidden Markov Models)-A New Method for Predicting Protein Secondary Structure[J].Journal of Biomathematics,2004,19(2):233-237. | |
| Authors: | SHI Feng MO Zhong-xi |
| Abstract: | |
| Keywords: | Hidden Markov Model (HMM) Viterbi algorithm Proteinl Secondary structure prediction |
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