首页 | 本学科首页   官方微博 | 高级检索  
     

无患子RT-qPCR内参基因的筛选与验证
作者姓名:徐圆圆  赵国春  郝颖颖  翁学煌  陈仲  贾黎明
作者单位:1. 北京林业大学林学院省部共建森林培育与保护教育部重点实验室;2. 北京林业大学国家能源非粮生物质原料研发中心;3. 北京林业大学无患子产业国家创新联盟;4. 福建源华林业生物科技有限公司;5. 北京林业大学林木分子设计育种高精尖创新中心
基金项目:国家自然科学基金项目(32071793);
摘    要:无患子根、茎、叶、花和果皮均含有生物活性物质三萜皂苷,为了解三萜皂苷生物合成途径中相关基因的表达水平,需要筛选稳定表达的内参基因。以无患子根、茎、叶、芽、雄花、雌花和不同发育时期的果皮为材料,根据无患子转录组数据,选择Sm18S,SmACT,SmTBCC,SmEF-1α,SmRPL1,SmRPS26,SmUBC12,SmUBP等8个基因作为候选内参基因。通过实时荧光定量PCR(RT-qPCR)检测这些候选内参基因的表达量,并利用geNorm、NormFider和BestKeeper三个软件及RefFinder在线分析工具评价候选内参基因的稳定性。结果表明,8个候选内参基因的表达量在所有样本间的变化幅度存在差异;geNorm、NormFinder和BestKeeper 3个软件筛选出的最佳内参基因略有不同;综合分析结果表明SmACT、SmRPL1和SmUBP表达较为稳定,SmEF-1α稳定性最差;以SmACT、SmACT+SmRPL1组合和SmACT+SmRPL1+SmUBP组合为内参对三萜皂苷生物合成途径中的8个候选基因进行校准所得的表达量基本上保持一致,且相对表达量结果与转录组数据基...

关 键 词:无患子  内参基因  实时荧光定量PCR  三萜皂苷生物合成  表达分析
设为首页 | 免责声明 | 关于勤云 | 加入收藏

Copyright©北京勤云科技发展有限公司  京ICP备09084417号