| 摘 要： | 为揭示苯丙烷代谢途径参与梭鱼草防御重金属胁迫的作用机制，分析镉(Cd)胁迫下梭鱼草叶片转录组序列，将其与NR、NT、PFAM、KOG、Swiss Prot、KEGG和GO公共数据库进行比对注释，并对差异表达基因进行趋势化分析，同时从中挖掘与苯丙烷代谢途径相关的差异表达基因。结果表明：(1)共获得221 392个unigenes，其中170 175个unigenes被注释到数据库，6 506个unigenes被注释到31条次生代谢通路；(2)将梭鱼草叶片unigenes与Swiss-Prot和Nr数据库进行比对，共得到168 355条CDS序列，Estscan软件预测得到84 673条序列；(3)对检测到的20 025个差异表达基因进行趋势分析，发现有3个显著的基因表达模式，包括2个下调表达模式(Cluster 0：2 631个基因，Cluster 1：3 153个基因)和1个上调表达模式(Cluster 5：3 733个基因)；(4)进一步挖掘转录组数据发现，在6＿0 h和48＿0 h组中，梭鱼草叶片中共有26个差异表达的基因被鉴定出来，分别编码3个苯丙烷代谢公共途径关键酶，5个木质素...
|
